RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 ASAP3Q8TDY4 903 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM62Q9BVG3 475 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 FANCFQ9NPI8 374 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SPTLC3Q9NUV7 552 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 COX16Q9P0S2 106 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM63CQ9P1W3 806 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM153AQ9UHL3 310 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 COG5Q9UP83 839 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 SAMM50Q9Y512 469 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 TRPV2Q9Y5S1 764 aa3.28□□□□□ -1.88
JMJD1C-210ENST00000542921 AATKQ6ZMQ8 1374 aa3.28□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC85CA6NKD9 419 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF432O94892 652 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FTCDO95954 541 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF18P17022 549 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PRKAR2BP31323 418 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MATKP42679 507 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC1A3P43003 542 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NPTX2P47972 431 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PRIM2P49643 509 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RAB5CP51148 216 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 HSF2Q03933 536 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 STRN3Q13033 797 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ELF2Q15723 593 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM187BQ17R55 369 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NIPAL3Q6P499 406 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NAPRTQ6XQN6 538 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GLYCTKQ8IVS8 523 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NPLOC4Q8TAT6 608 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SETD6Q8TBK2 473 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CNKSR1Q969H4 720 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CDHR1Q96JP9 859 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TIMM29Q9BSF4 260 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GLT8D2Q9H1C3 349 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MROH8Q9H579 483 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A0G2JN53 185 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TSTD3H0UI37 97 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MYO1FO00160 1098 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NR3C2P08235 984 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 VARSP26640 1264 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 HPDP32754 393 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GUCY2DQ02846 1103 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC34A1Q06495 639 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TFCP2Q12800 502 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 AGERQ15109 404 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 OLFML1Q6UWY5 402 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TTLL10Q6ZVT0 673 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GPBP1Q86WP2 473 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CKAP2LQ8IYA6 745 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SETD9Q8NE22 299 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GIPC3Q8TF64 312 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FNBP1Q96RU3 617 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 COPRSQ9NQ92 184 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC5A4Q9NY91 659 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 IRAK3Q9Y616 596 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ERCC6Q03468 1493 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ASB14A6NK59 587 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FCHO1O14526 889 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 F13A1P00488 732 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CYP3A4P08684 503 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FSHRP23945 695 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PTPN5P54829 565 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC35A2P78381 396 aa3.27□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SMARCB1Q12824 385 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms