RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540719.1

QKI-211, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, humanhuman

TSL 2

Gene QKI, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKI-211ENST00000540719 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.5□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 LAMA1P25391 3075 aa9.5□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 K7ESF4 209 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 KINO60870 393 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 FGF19O95750 216 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CCNE1P24864 410 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 GABRR2P28476 465 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 SAAL1Q96ER3 474 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 FAM84AQ96KN4 292 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ACCSQ96QU6 501 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 BACH2Q9BYV9 841 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 TASP1Q9H6P5 420 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CEP250Q9BV73 2442 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 SOBPA7XYQ1 873 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 EXTL3O43909 919 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 TADA3O75528 432 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 HOXA6P31267 233 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CTHP32929 405 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 PNPLA4P41247 253 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 SOX9P48436 509 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 NLRP12P59046 1061 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CYP4F8P98187 520 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 SATB1Q01826 763 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 EHHADHQ08426 723 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ALCAMQ13740 583 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CCINQ13939 588 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 SV2CQ496J9 727 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 GPR158Q5T848 1215 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 FAM171BQ6P995 826 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ITIH5Q86UX2 942 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 OSTM1Q86WC4 334 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 SPATA18Q8TC71 538 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 MYRFLQ96LU7 910 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ACBD6Q9BR61 282 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ABCB6Q9NP58 842 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 PANK4Q9NVE7 773 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 PTPRJQ12913 1337 aa9.48□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 STX6O43752 255 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 PPP6R2O75170 966 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 GCNT3O95395 438 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ITGB3P05106 788 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CDC25CP30307 473 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 HOXC13P31276 330 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 GPR15P49685 360 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CDR1P51861 262 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 TNK2Q07912 1038 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 CCDC142Q17RM4 750 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 METTL23Q86XA0 190 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 GIPC2Q8TF65 315 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.47□□□□□ -0.89
QKI-211ENST00000540719 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms