RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 UBXN11Q5T124 520 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf127Q8N9H9 656 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM51Q9BSJ1 452 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ASB7Q9H672 318 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CISHQ9NSE2 258 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CD58P19256 250 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PRMT2P55345 433 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 C2CD6Q53TS8 623 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 DPH5Q9H2P9 285 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CTSHP09668 335 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 AXLP30530 894 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 MGAT3Q09327 533 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 MAMLD1Q13495 774 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGA7Q13683 1181 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF6Q15052 776 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PTGISQ16647 500 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP1B1Q16678 543 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 DUPD1Q68J44 220 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 JAMLQ86YT9 394 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM76AQ8TAV0 307 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 C18orf8Q96DM3 657 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM7Q9C029 511 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PODXLO00592 558 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PROSCO94903 275 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RPAINQ86UA6 219 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CD302Q8IX05 232 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PARVAQ9NVD7 372 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SCN1AP35498 2009 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PTP4A2Q12974 167 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM31Q9BZY9 425 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 WEE2P0C1S8 567 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 MMP8P22894 467 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ASPAP45381 313 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 MTMR3Q13615 1198 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CALB1P05937 261 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RARAP10276 462 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PTGIRP43119 386 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX27Q96L92 541 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF39Q9H2S5 420 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ERICH4A6NGS2 130 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 FSCN2O14926 492 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CABYRO75952 493 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGB3P05106 788 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT19P08727 400 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPN2P17655 700 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 GBP1P32455 592 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 HSD17B3P37058 310 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF394Q53GI3 561 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 LRIG3Q6UXM1 1119 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ALKAL1Q6UXT8 129 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RSPH3Q86UC2 560 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF19AQ9NV58 838 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 C2CD2Q9Y426 696 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT14P02533 472 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 AKAP5P24588 427 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 COILP38432 576 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 FNTAP49354 379 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC27Q6P3X3 843 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.45■■□□□ 1.02
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