RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 H3BNC9 293 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC172P0C7W6 258 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 CTSAP10619 480 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT5P13647 590 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 LMO2P25791 158 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 GLUD2P49448 558 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 BPIFB4P59827 614 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF280DQ6N043 979 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TC2NQ8N9U0 490 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 SPC24Q8NBT2 197 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM176AQ96HP8 235 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TWNKQ96RR1 684 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBP1Q9H171 429 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 CDH9Q9ULB4 789 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA1257Q9ULG3 409 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 IRAK3Q9Y616 596 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 OR6C75A6NL08 312 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 URODP06132 367 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 FERP16591 822 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CLCN1P35523 988 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 GSDMDP57764 484 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC4A11Q8NBS3 891 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 B3GALT6Q96L58 329 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ABHD10Q9NUJ1 306 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 MTRRQ9UBK8 725 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 TRANK1O15050 2925 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP26A1O43174 497 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 LILRB3O75022 631 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PRKCIP41743 596 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CDH23Q9H251 3354 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 GFPT2O94808 682 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PDGFRBP09619 1106 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 USP8P40818 1118 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PTK2Q05397 1052 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF394Q53GI3 561 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 POF1BQ8WVV4 589 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PANX2Q96RD6 677 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CREMQ03060 361 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 MEA1Q16626 185 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM171BQ6P995 826 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PKMYT1Q99640 499 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 SYT15Q9BQS2 421 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 TLR9Q9NR96 1032 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 FNIP2Q9P278 1114 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 GRM6O15303 877 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 HCRTO43612 131 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 TSPY1Q01534 308 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 GPM6BQ13491 265 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CAMK1Q14012 370 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPN14Q15678 1187 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMD5Q16401 504 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ACOT1Q86TX2 421 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 EPS8L1Q8TE68 723 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 VDRP11473 427 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP11B1P15538 503 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 FECHP22830 423 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJB1P25685 340 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CDK17Q00537 523 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 SMARCB1Q12824 385 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ASIC2Q16515 512 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 HGSNATQ68CP4 663 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR59Q6PJI9 974 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 TMC7Q7Z402 723 aa23.41■■□□□ 1.34
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