RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 CLIC6Q96NY7 704 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC46A2Q9BY10 475 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 TMLHEQ9NVH6 421 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 DSEQ9UL01 958 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB23Q9ULC3 237 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 C2CD2Q9Y426 696 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 MYBPHLA2RUH7 354 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 GPR15P49685 360 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC32Q14392 662 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 BPIFB1Q8TDL5 484 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 SAAL1Q96ER3 474 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 IER2Q9BTL4 223 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 MYMKA6NI61 221 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 HRO43593 1189 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 FGF19O95750 216 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 MCM2P49736 904 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 PTPAQ15257 358 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 GCNAQ96QF7 691 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 KPNA7A9QM74 516 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 PAX3P23760 479 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 CDC25CP30307 473 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 DCDC2BA2VCK2 349 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 K7ESF4 209 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCD1P33897 745 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 SV2CQ496J9 727 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 MSANTD3Q96H12 275 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 PANK2Q9BZ23 570 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 GKN1Q9NS71 199 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 OBP2AQ9NY56 170 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 CCL26Q9Y258 94 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 OBSL1O75147 1896 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 SDK1Q7Z5N4 2213 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP1R37O75864 691 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 LMNB2Q03252 620 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 DGKKQ5KSL6 1271 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM68Q6AZZ1 485 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM150AQ86TG1 271 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 STRA6Q9BX79 667 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 IL18RAPO95256 599 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 ITGB3P05106 788 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 CASP5P51878 434 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC142Q17RM4 750 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 TXNDC8Q6A555 127 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 PKN3Q6P5Z2 889 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 ACCSQ96QU6 501 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 HCRTO43612 131 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 GCNT3O95395 438 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 F11P03951 625 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 IDEP14735 1019 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP8P85298 464 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 CCINQ13939 588 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 POSTNQ15063 836 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 SV2BQ7L1I2 683 aa25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms