RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 PNKPQ96T60 521 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MAP3K14Q99558 947 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PACSIN1Q9BY11 444 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 ETAA1Q9NY74 926 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PLXNC1O60486 1568 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 A0A1W2PS29 197 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 H3BML4 177 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 TSPAN6O43657 245 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 OFD1O75665 1012 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CDKL5O76039 1030 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 FTH1P19P0C7X4 201 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SPATA31D3P0C874 917 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MYBP10242 640 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 HDCP19113 662 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 FDXRP22570 491 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 GATA3P23771 443 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MPLP40238 635 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 GUCY1B3Q02153 619 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 EMC10Q5UCC4 262 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CHPFQ8IZ52 775 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 FAM43AQ8N2R8 423 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 KLHDC4Q8TBB5 520 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CHFRQ96EP1 664 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MRIQ9BWK5 157 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MTUS2Q5JR59 1369 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PZPP20742 1482 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 DEPDC5O75140 1603 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SYNMO15061 1565 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 KDM5DQ9BY66 1539 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 NLRP1Q9C000 1473 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 A0A088AWK7 358 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SUV39H1O43463 412 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 B3GALT2O43825 422 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 UBXN7O94888 489 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 TGM1P22735 817 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SMARCA1P28370 1054 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PIK3CGP48736 1102 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 VAV2P52735 878 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 GALEQ14376 348 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SYNE4Q8N205 404 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 POC1BQ8TC44 478 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SCAMP4Q969E2 229 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MED15Q96RN5 788 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 TTPALQ9BTX7 342 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 WDCPQ9H6R7 721 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 PNPOQ9NVS9 261 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 RLIMQ9NVW2 624 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 SRRDQ9UH36 339 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 CDYLQ9Y232 598 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-209ENST00000522928 MED14O60244 1454 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM94Q12767 1356 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 MAST3O60307 1309 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 DTNBO60941 627 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TUSC2O75896 110 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 DNAJB5O75953 348 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ARIH2O95376 493 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ANXA1P04083 346 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 HLA-DOAP06340 250 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TSPY4P0CV99 314 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TSPY10P0CW01 314 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 KCNA2P16389 499 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TYRP1P17643 537 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 HTR1BP28222 390 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ADRA1BP35368 520 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SEC24CP53992 1094 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PPP2R5AQ15172 486 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PTPAQ15257 358 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ATP2B3Q16720 1220 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ABHD17BQ5VST6 288 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms