RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ITGAL	P20701	1170 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	DRD4	P21917	467 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	HASPIN	Q8TF76	798 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	FAM136A	Q96C01	138 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	SIK2	Q9H0K1	926 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		5.71	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057		M0QYG6	137 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PDHA1	P08559	390 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	NR2F6	P10588	404 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	JUP	P14923	745 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	CD6	P30203	668 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP10-11	P60412	298 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	TFF2	Q03403	129 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PGS1	Q32NB8	556 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	EHD3	Q9NZN3	535 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	RAD54B	Q9Y620	910 aa		5.7	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	IL33	O95760	270 aa		5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	TTLL1	O95922	423 aa		5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	GNAI2	P04899	355 aa		5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF134	P52741	427 aa		5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	TBCC	Q15814	346 aa		5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	EMC10	Q5UCC4	262 aa		5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	GPATCH3	Q96I76	525 aa		5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	FAM167A	Q96KS9	214 aa		5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		5.69	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	DCLK1	O15075	740 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PPM1D	O15297	605 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	DNAJB5	O75953	348 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PRKCG	P05129	697 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	EBLN1	P0CF75	366 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ABCG1	P45844	678 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	CCT8	P50990	548 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PLS1	Q14651	629 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	DDB2	Q92466	427 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	HESX1	Q9UBX0	185 aa		5.68	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	CELA2A	P08217	269 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	HDC	P19113	662 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	AKAP5	P24588	427 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	NEK2	P51955	445 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	BMPR2	Q13873	1038 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	FAM153C	Q494X1	144 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	MAVS	Q7Z434	540 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	SLC35A4	Q96G79	324 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PADI4	Q9UM07	663 aa		5.67	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF213	O14771	459 aa		5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ALDH2	P05091	517 aa		5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	SP2	Q02086	613 aa		5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PTPRO	Q16827	1216 aa		5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	HPS3	Q969F9	1004 aa		5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	REPS1	Q96D71	796 aa		5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		5.66	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	TARM1	B6A8C7	271 aa		5.65	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057		H3BUI4	141 aa		5.65	□□□□□ -1.5
COPS5-208	ENST00000519057	NXPH3	O95157	252 aa		5.65	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms