RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516553.1

RNU6-506P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 506, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-506P, Length 94 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-506P-201ENST00000516553 WDCPQ9H6R7 721 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SERTAD4Q9NUC0 356 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 DKK3Q9UBP4 350 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 PADI4Q9UM07 663 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 RAD54BQ9Y620 910 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 PCSK6P29122 969 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 CD6P30203 668 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 CCT8P50990 548 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 BMPR2Q13873 1038 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 TBCCQ15814 346 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 PLAC9Q5JTB6 97 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 VPS53Q5VIR6 699 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 USP37Q86T82 979 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 RGMAQ96B86 450 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 FAM136AQ96C01 138 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF778Q96MU6 729 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 ABCF2Q9UG63 623 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 LINC01548A6NM66 108 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 DTNBO60941 627 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 IGSF3O75054 1194 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 EBLN1P0CF75 366 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 JUPP14923 745 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF81P51508 661 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 USP45Q70EL2 814 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SERHLQ9NQF3 203 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 WDR91A4D1P6 747 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 TARM1B6A8C7 271 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 GNAI2P04899 355 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 POU2F2P09086 479 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 TYRP14679 529 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 MAP2K6P52564 334 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 LLGL1Q15334 1064 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 PPP1R3BQ86XI6 285 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 KLHDC4Q8TBB5 520 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 ARHGEF3Q9NR81 526 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-506P-201ENST00000516553 M0QYG6 137 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 PPM1DO15297 605 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 NXPH3O95157 252 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 AHSGP02765 367 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 PDHA1P08559 390 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 EPHA10Q5JZY3 1008 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 TMEM240Q5SV17 173 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 DTX2Q86UW9 622 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 CPA6Q8N4T0 437 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 FAM167AQ96KS9 214 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 NELL2Q99435 816 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 LATS1O95835 1130 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 ERBB2P04626 1255 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 FAM163BP0C2L3 166 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 NDUFB7P17568 137 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF134P52741 427 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 GRM1Q13255 1194 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 CEP85Q6P2H3 762 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 VGLL2Q8N8G2 317 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 REPS1Q96D71 796 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-506P-201ENST00000516553 PCDH12Q9NPG4 1184 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms