RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 IQCB1Q15051 598 aa21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 WDR44Q5JSH3 913 aa21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 CHST7Q9NS84 486 aa21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PIEZO1Q92508 2521 aa21.63■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 AVPR2P30518 371 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PIK3CAP42336 1068 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 FMO5P49326 533 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 NCOA4Q13772 614 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 NCAPHQ15003 741 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PDXDC1Q6P996 788 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 ZNF516Q92618 1163 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.62■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 MYL7Q01449 175 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 VWA3BQ502W6 1294 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 GPR65Q8IYL9 337 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 APPL2Q8NEU8 664 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 HPDLQ96IR7 371 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 B3GALT6Q96L58 329 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 RAB20Q9NX57 234 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 FNIP2Q9P278 1114 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 DSEQ9UL01 958 aa21.61■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PTPRJQ12913 1337 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 KPNA7A9QM74 516 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 KIF4AO95239 1232 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 C1RP00736 705 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 GUCY2FP51841 1108 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 LILRA4P59901 499 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PPP3CAQ08209 521 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 DPH6Q7L8W6 267 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PALB2Q86YC2 1186 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 RABGGTAQ92696 567 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 NDST4Q9H3R1 872 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PIDD1Q9HB75 910 aa21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 SYN3O14994 580 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 HUS1O60921 280 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 SERPINC1P01008 464 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 FAM163BP0C2L3 166 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 ODC1P11926 461 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 ZNF18P17022 549 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 TNNC1P63316 161 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 ZNF699Q32M78 642 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 LUZP1Q86V48 1076 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 METTL23Q86XA0 190 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 SUSD3Q96L08 255 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 FAM81BQ96LP2 452 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 SIX4Q9UIU6 781 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.59■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 CLUHO75153 1309 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 TRIP11Q15643 1979 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 TGM5O43548 720 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 RFPL2O75678 378 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 HLA-DRAP01903 254 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 TPM3P06753 285 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 SPATA31D3P0C874 917 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 TCF15Q12870 199 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 TDGQ13569 410 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 GBP6Q6ZN66 633 aa21.58■■□□□ 1.05
USP53-208ENST00000514305 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms