RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-221ENST00000514231 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 VWC2LB2RUY7 222 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 VPS4BO75351 444 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 AHSGP02765 367 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 PDGFRBP09619 1106 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 ELFN1P0C7U0 828 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 IL12RB1P42701 662 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 PBKQ96KB5 322 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 ASB6Q9NWX5 421 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 OFD1O75665 1012 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 ALDH2P05091 517 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 RFKQ969G6 155 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 SLC35A4Q96G79 324 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 MCL1Q07820 350 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 FAM136AQ96C01 138 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 CGRRF1Q99675 332 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 EHD3Q9NZN3 535 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 LINC00473A8K010 186 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 M0QYG6 137 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 HDCP19113 662 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 GPD1P21695 349 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 ITPKBP27987 946 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 CD6P30203 668 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 BMPR2Q13873 1038 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 SARAFQ96BY9 339 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 HAPLN3Q96S86 360 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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PDE4D-221ENST00000514231 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 RHOP08100 348 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 CHRM3P20309 590 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 SOX8P57073 446 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 FKBP10Q96AY3 582 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 AIFM3Q96NN9 605 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 A0A088AWK7 358 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 AKAP10O43572 662 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 AP1G1O43747 822 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 TTLL1O95922 423 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 NR2F6P10588 404 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 RAB27AP51159 221 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 GTF2H3Q13889 308 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 FAM153CQ494X1 144 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 LONRF3Q496Y0 759 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 VPS53Q5VIR6 699 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 DTX2Q86UW9 622 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 HESX1Q9UBX0 185 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-221ENST00000514231 RFPL1O75677 317 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-221ENST00000514231 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-221ENST00000514231 HSPA6P17066 643 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-221ENST00000514231 EPHB1P54762 984 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-221ENST00000514231 FGL2Q14314 439 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-221ENST00000514231 IQCB1Q15051 598 aa6.58□□□□□ -1.36
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