RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513522.5

CCSER1-211, Transcript of coiled-coil serine rich protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCSER1, Length 605 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1-211ENST00000513522 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 TNMDQ9H2S6 317 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 IKZF4Q9H2S9 585 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 TMX1Q9H3N1 280 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 DACT1Q9NYF0 836 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 PARP2Q9UGN5 583 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 AKT3Q9Y243 479 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 GINS2Q9Y248 185 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 TISP43B9A030 160 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 MATN3O15232 486 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 SLC16A4O15374 487 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 B4GALT5O43286 388 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 MGEA5O60502 916 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 B3GALT4O96024 378 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CXCL10P02778 98 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 HPXP02790 462 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 PLS3P13797 630 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 RAG1P15918 1043 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 BMP6P22004 513 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 TMOD1P28289 359 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CD52P31358 61 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 SARSP49591 514 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 ASIC1P78348 528 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 STK4Q13043 487 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 COASYQ13057 564 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 BFSP2Q13515 415 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CAMK4Q16566 473 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 MFSD5Q6N075 450 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 UNC13DQ70J99 1090 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 DEFB128Q7Z7B8 93 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 ZNF605Q86T29 641 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 SFR1Q86XK3 245 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 IRF2BP1Q8IU81 584 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CEP57L1Q8IYX8 460 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 NME8Q8N427 588 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 DBF4BQ8NFT6 615 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 SPATA20Q8TB22 786 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 KIFAP3Q92845 792 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 ISL2Q96A47 359 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 TIGD1Q96MW7 591 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 GBP4Q96PP9 640 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 MAP7D2Q96T17 732 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 HTATIP2Q9BUP3 242 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 STRA6Q9BX79 667 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 RNF32Q9H0A6 362 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 FZD8Q9H461 694 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CUEDC2Q9H467 287 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 PARVGQ9HBI0 331 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 TBC1D7Q9P0N9 293 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 PADI3Q9ULW8 664 aa4.55□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 DENND3A2RUS2 1198 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 LRRIQ4A6NIV6 560 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 SLC22A31A6NKX4 558 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CCDC169A6NNP5 214 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 ABLIM1O14639 778 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 ASAP2O43150 1006 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 TSPAN1O60635 241 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 CAND2O75155 1236 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 RPS6KA5O75582 802 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 MYBP10242 640 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 IDEP14735 1019 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 VAMP1P23763 118 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 NAMPTP43490 491 aa4.54□□□□□ -1.68
CCSER1-211ENST00000513522 DNM2P50570 870 aa4.54□□□□□ -1.68
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