RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508176.1

FBXO38-210, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 2

Gene FBXO38, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-210	ENST00000508176	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	DTNB	O60941	627 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	CD6	P30203	668 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	PHKA1	P46020	1223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	CCT8	P50990	548 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	USP45	Q70EL2	814 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	USP37	Q86T82	979 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	IGSF3	O75054	1194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	VPS4B	O75351	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	NXPH3	O95157	252 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	CHRM3	P20309	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	TFF2	Q03403	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	TBCC	Q15814	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	DDB2	Q92466	427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-210	ENST00000508176	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	GNAI2	P04899	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	POU2F2	P09086	479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	TYR	P14679	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	MAP2K6	P52564	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	NELL2	Q99435	816 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176		M0QYG6	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	JUP	P14923	745 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	ZNF81	P51508	661 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	PPM1D	O15297	605 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	LATS1	O95835	1130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	AHSG	P02765	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	ZNF134	P52741	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	ZNF213	O14771	459 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	DNAJB5	O75953	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	PDHA1	P08559	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-210	ENST00000508176	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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