RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R2P41236 205 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 CASP4P49662 377 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 VAMP7P51809 220 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE2HP62256 183 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 CLDN10P78369 228 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP72Q9P209 647 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 P4HA1P13674 534 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 PRCPP42785 496 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 NCOA4Q13772 614 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ING5Q8WYH8 240 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 GABRDO14764 452 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MYL6P60660 151 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF699Q32M78 642 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA20Q8TB22 786 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR88Q9GZN0 384 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 CDH9Q9ULB4 789 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-210ENST00000505941 ANHXE9PGG2 379 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMA7O14818 248 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 AKAP3O75969 853 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 VNN2O95498 520 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 COL9A1P20849 921 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 ENPEPQ07075 957 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMG2Q969U7 264 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 GCNAQ96QF7 691 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCB6Q9NP58 842 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 STX10O60499 249 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 TACC1O75410 805 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 PDGFRBP09619 1106 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 DLG4P78352 724 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 HTR4Q13639 388 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 TAF4BQ92750 862 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 SYT15Q9BQS2 421 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 TSC2P49815 1807 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 SOAT2O75908 522 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 CEBPBP17676 345 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 PIK3CAP42336 1068 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 CDR1P51861 262 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 EPHA5P54756 1037 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC63Q05C16 580 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 ZACNQ401N2 412 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 ISM2Q6H9L7 571 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 PARM1Q6UWI2 310 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 SV2AQ7L0J3 742 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-210ENST00000505941 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms