RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 CCDC142Q17RM4 750 aa24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 GAREM2Q75VX8 874 aa24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 LEMD2Q8NC56 503 aa24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SMARCD2Q92925 531 aa24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 HPSEQ9Y251 543 aa24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 NCANO14594 1321 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 HUS1O60921 280 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 TUFMP49411 452 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PSMG2Q969U7 264 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 RSPRY1Q96DX4 576 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SIT1Q9Y3P8 196 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ASB3Q9Y575 518 aa24.37■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 GLULP15104 373 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 GPR15P49685 360 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 NDUFA8P51970 172 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 CYP24A1Q07973 514 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SURF1Q15526 300 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 VITQ6UXI7 678 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 STKLD1Q8NE28 680 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ZNF516Q92618 1163 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 HPDLQ96IR7 371 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PI4K2AQ9BTU6 479 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 HSFX1Q9UBD0 423 aa24.36■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 UBE4BO95155 1302 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 TNNC2P02585 160 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 GABRR2P28476 465 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ACBD6Q9BR61 282 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ATXN3LQ9H3M9 355 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 IL21Q9HBE4 155 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 FAM186AA6NE01 2351 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SHISA7A6NL88 538 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 GABRDO14764 452 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ATP2C2O75185 946 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PRR29P0C7W0 189 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 TNNI1P19237 187 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 LMO2P25791 158 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SYKP43405 635 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 TSPY1Q01534 308 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PFKPQ01813 784 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PSMD6Q15008 389 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 WDR49Q8IV35 697 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SPPL2BQ8TCT7 592 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SHDQ96IW2 340 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PKMYT1Q99640 499 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 HEBP1Q9NRV9 189 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 HEPACAM2A8MVW5 462 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 CYP2F1P24903 491 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 GDI1P31150 447 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 CASP4P49662 377 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ITIH5Q86UX2 942 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 PJA1Q8NG27 643 aa24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms