RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 ETAA1Q9NY74 926 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.36□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 9.2
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00473A8K010 186 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 GPD1P21695 349 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 PLS1Q14651 629 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 LAYNQ6UX15 382 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 FKBP10Q96AY3 582 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC136Q96JN2 1154 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 ARMT1Q9H993 441 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 KAT6AQ92794 2004 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 AP1G1O43747 822 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 TTLL1O95922 423 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 PDGFRBP09619 1106 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 NR2F6P10588 404 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 HPS3Q969F9 1004 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 VOPP1Q96AW1 172 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM136AQ96C01 138 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 LRGUKQ96M69 825 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 HAPLN3Q96S86 360 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 ALG8Q9BVK2 526 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 TTYH3Q9C0H2 523 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 CPA4Q9UI42 421 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHA6Q9UN73 950 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-210ENST00000485459 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 VWC2LB2RUY7 222 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ALDH2P05091 517 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 EBLN1P0CF75 366 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 IL12RB1P42701 662 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 SOX8P57073 446 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 TBCCQ15814 346 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 PBKQ96KB5 322 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 CGRRF1Q99675 332 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 EHD3Q9NZN3 535 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 E2F8A0AVK6 867 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ABLIM3O94929 683 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 UNC5CO95185 931 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 HDCP19113 662 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 LONRF3Q496Y0 759 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 AMOTQ4VCS5 1084 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 VPS53Q5VIR6 699 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 RASAL3Q86YV0 1011 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 PCSK5Q92824 1860 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 PROP1O75360 226 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 C1QL1O75973 258 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 NXPH3O95157 252 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 GRPP07492 148 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ELFN1P0C7U0 828 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 HSPA6P17066 643 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 SATB1Q01826 763 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 MCL1Q07820 350 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 TCF15Q12870 199 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.8 ms