RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 I3L4J1 428 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 MED7O43513 233 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 C1RP00736 705 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CTSAP10619 480 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 DNAJB2P25686 324 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 RAP1GAPP47736 663 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 GLUD2P49448 558 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 PDE6CP51160 858 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 NDST1P52848 882 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CDH8P55286 799 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 ASIC2Q16515 512 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 TC2NQ8N9U0 490 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 SPC24Q8NBT2 197 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 MTRRQ9UBK8 725 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 IRAK3Q9Y616 596 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 H3BNC9 293 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 GFPT2O94808 682 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 SERPING1P05155 500 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 VDRP11473 427 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 MYOGP15173 224 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 FECHP22830 423 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 USP8P40818 1118 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 RAD23BP54727 409 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CTXN3Q4LDR2 81 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 RTP2Q5QGT7 225 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 KIAA0319Q5VV43 1072 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 VPS36Q86VN1 386 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CEP57Q86XR8 500 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 VPS52Q8N1B4 723 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 SLC4A11Q8NBS3 891 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 WHAMMQ8TF30 809 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 ELMO3Q96BJ8 720 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 TIFAQ96CG3 184 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 SYT15Q9BQS2 421 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 VN1R3Q9BXE9 311 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 ZBP1Q9H171 429 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 FNIP2Q9P278 1114 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 MAFFQ9ULX9 164 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 GBF1Q92538 1859 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 ATP8B3O60423 1300 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CYP26A1O43174 497 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 TBC1D4O60343 1298 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CYP11B1P15538 503 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 GNA15P30679 374 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CLCN1P35523 988 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 PBX2P40425 430 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 ADKP55263 362 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 KLHL30Q0D2K2 578 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 PSMD5Q16401 504 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 SGO2Q562F6 1265 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 ARHGAP17Q68EM7 881 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 SLC8B1Q6J4K2 584 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 TRIM72Q6ZMU5 477 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 C4orf50Q6ZRC1 276 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 OSTM1Q86WC4 334 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 SPPL3Q8TCT6 385 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 ELOVL4Q9GZR5 314 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 RXFP1Q9HBX9 757 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 TLR9Q9NR96 1032 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 LPXNO60711 386 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 LMO2P25791 158 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 GPM6BQ13491 265 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 PTPN14Q15678 1187 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CNGA2Q16280 664 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 FAM171BQ6P995 826 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 CCDC186Q7Z3E2 898 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 TMTC1Q8IUR5 882 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 EPS8L1Q8TE68 723 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 POF1BQ8WVV4 589 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-208ENST00000481211 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms