RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 PIK3CAP42336 1068 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TCF15Q12870 199 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CAMK1Q14012 370 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 SPPL3Q8TCT6 385 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 BAP1Q92560 729 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF516Q92618 1163 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 UROC1Q96N76 676 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 MIS12Q9H081 205 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 GANQ9H2C0 597 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 HAUS4Q9H6D7 363 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 DPP3Q9NY33 737 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 SNTG2Q9NY99 539 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 PARP2Q9UGN5 583 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC53A6NM62 1247 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 INPPL1O15357 1258 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 MED7O43513 233 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 KRT86O43790 486 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 NDUFA10O95299 355 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 LCA5LO95447 670 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ITGB1P05556 798 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TNFAIP3P21580 790 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 JAM2P57087 298 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 OSTNP61366 133 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CCZ1BP86790 482 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 KIF5AQ12840 1032 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CUL2Q13617 745 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TUBB2AQ13885 445 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 DSC3Q14574 896 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 LPIN1Q14693 890 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 STILQ15468 1287 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 SLC18A3Q16572 532 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 IQCEQ6IPM2 695 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 POF1BQ8WVV4 589 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 SHC3Q92529 594 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF560Q96MR9 790 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ADAM2Q99965 735 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CLEC1BQ9P126 229 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 IPPQ9Y573 584 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ATP8B3O60423 1300 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 F8VZ95 297 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 SMAPO00193 183 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TRAPPC3O43617 180 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 RECQL4O94761 1208 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CSPG5O95196 566 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 KRT19P08727 400 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 PAEPP09466 180 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CXCL8P10145 99 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 DNAJB1P25685 340 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 AVPR2P30518 371 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 LRPAP1P30533 357 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 CD52P31358 61 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TNFSF9P41273 254 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 NRIP1P48552 1158 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TNNC1P63316 161 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 UBE3AQ05086 875 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 PTPN14Q15678 1187 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF699Q32M78 642 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-207ENST00000475558 UBXN11Q5T124 520 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms