RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	MYADM	Q96S97	322 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	FANCG	O15287	622 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	PAPLN	O95428	1278 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	EFEMP2	O95967	443 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	UQCRH	P07919	91 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	MLH1	P40692	756 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SCNN1G	P51170	649 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	VAMP7	P51809	220 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DLG4	P78352	724 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	MYL7	Q01449	175 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CREM	Q03060	361 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DSC1	Q08554	894 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CAPS	Q13938	189 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GAD1	Q99259	594 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	TGM5	O43548	720 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	TSPAN1	O60635	241 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ABL1	P00519	1130 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	PIGR	P01833	764 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SERPING1	P05155	500 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	LAMP2	P13473	410 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	UCHL3	P15374	230 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GART	P22102	1010 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SCP2	P22307	547 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	PTEN	P60484	403 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GNG11	P61952	73 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	KRT83	P78385	493 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	TFDP1	Q14186	410 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ASIC2	Q16515	512 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GJB7	Q6PEY0	223 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	BICD1	Q96G01	975 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364		R4GN57	208 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF292	O60281	2723 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF263	O14978	683 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	LCA5L	O95447	670 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RUBCN-208	ENST00000471364	CASQ1	P31415	396 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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