RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRSS33Q8NF86 280 aa20.25■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ACBD6Q9BR61 282 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC3Q9BY71 257 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 GABRDO14764 452 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF202O95125 648 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIF20AO95235 890 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 FGF19O95750 216 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 NPR3P17342 541 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATF6P18850 670 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 FCARP24071 287 aa20.24■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 DPH6Q7L8W6 267 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ASB16Q96NS5 453 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABCB6Q9NP58 842 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 DMAC2Q9NW81 257 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 COL4A2P08572 1712 aa20.23■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PCSK1P29120 753 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTPN5P54829 565 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 PFKPQ01813 784 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNB1Q14721 858 aa20.23■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 FLCNQ8NFG4 579 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 PKMYT1Q99640 499 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR88Q9GZN0 384 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 CA14Q9ULX7 337 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTPRDP23468 1912 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.23■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMARCD2Q92925 531 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.21■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 GJA1P17302 382 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 RFX1P22670 979 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TCF15Q12870 199 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 NFIL3Q16649 462 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GAREM2Q75VX8 874 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF516Q92618 1163 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 SHDQ96IW2 340 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDC25CP30307 473 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATICP31939 592 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CASP4P49662 377 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNNC1P63316 161 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRKCQQ04759 706 aa20.19■□□□□ 0.82
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