RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ITGAVP06756 1048 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 P4HA1P13674 534 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 DESP17661 470 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TMOD1P28289 359 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ATICP31939 592 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 VEGFBP49765 207 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 LIG3P49916 1009 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ITGA8P53708 1063 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CNGA2Q16280 664 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SKIDA1Q1XH10 827 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ICE2Q659A1 982 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 DCUN1D2Q6PH85 259 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 C4orf22Q6V702 233 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 GSTA5Q7RTV2 222 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ERICH1Q86X53 443 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 NT5DC4Q86YG4 428 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 DYDC1Q8WWB3 177 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 C1orf54Q8WWF1 131 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CPA5Q8WXQ8 436 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SELENOSQ9BQE4 189 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CYP3A43Q9HB55 503 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 IFT122Q9HBG6 1241 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SLC24A2Q9UI40 661 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SHOC2Q9UQ13 582 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SIP14410 1827 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 BTBD19C9JJ37 291 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PDHXO00330 501 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ACKR2O00590 384 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CHUKO15111 745 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ATP5HO75947 161 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SHBGP04278 402 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 RALAP11233 206 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ATP4AP20648 1035 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SLC8A1P32418 973 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 PHBP35232 272 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 KCNJ1P48048 391 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TM4SF4P48230 202 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ACOT2P49753 483 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 HTRA3P83110 453 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 IL9RQ01113 521 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 XRCC4Q13426 336 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 DGKZQ13574 1117 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 MOGSQ13724 837 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 STILQ15468 1287 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TREML2Q5T2D2 321 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CCDC25Q86WR0 208 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CCT6BQ92526 530 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TCHPQ9BT92 498 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ALOX15BO15296 676 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 MAGEB2O15479 319 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 CA12O43570 354 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 LIASO43766 372 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 HBP1O60381 514 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 MSCO60682 206 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 AOC2O75106 756 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-208ENST00000464611 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms