RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 CTXN3Q4LDR2 81 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF394Q53GI3 561 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP2R2DQ66LE6 453 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC186Q7Z3E2 898 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 OSTM1Q86WC4 334 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS52Q8N1B4 723 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 TC2NQ8N9U0 490 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 WHAMMQ8TF30 809 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R9BQ96SB3 815 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 C17orf80Q9BSJ5 609 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 BACE2Q9Y5Z0 518 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 MED7O43513 233 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 LPXNO60711 386 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPING1P05155 500 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CTSAP10619 480 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CD19P15391 556 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJB2P25686 324 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 LMO2P25791 158 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 GNA15P30679 374 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CLCN1P35523 988 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKCIP41743 596 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PDE6CP51160 858 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK17Q00537 523 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ARID5AQ03989 594 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 SMARCB1Q12824 385 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 STILQ15468 1287 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 MEA1Q16626 185 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 LRIT3Q3SXY7 679 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 SGO2Q562F6 1265 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 RTP2Q5QGT7 225 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 TAS1R1Q7RTX1 841 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS36Q86VN1 386 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF677Q86XU0 584 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC4A11Q8NBS3 891 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC112Q8NEF3 446 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 SPPL3Q8TCT6 385 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 TIFAQ96CG3 184 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 SYT15Q9BQS2 421 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 VN1R3Q9BXE9 311 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 MTRRQ9UBK8 725 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BNC9 293 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 THAP12O43422 761 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF15O94989 841 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP11B1P15538 503 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ANXA13P27216 316 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA8FQ08AF8 430 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 GPM6BQ13491 265 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CNGA2Q16280 664 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMD5Q16401 504 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 TMC7Q7Z402 723 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ACOT1Q86TX2 421 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC47A2Q86VL8 602 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 POF1BQ8WVV4 589 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 TWNKQ96RR1 684 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBP1Q9H171 429 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 TLR9Q9NR96 1032 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 FNIP2Q9P278 1114 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 HMGXB4Q9UGU5 601 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP8B3O60423 1300 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 C2CD2LO14523 706 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 TBC1D4O60343 1298 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 CXCL14O95715 111 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-208ENST00000462602 SKILP12757 684 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms