RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 HUS1O60921 280 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF4AO95239 1232 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 NOMO3P69849 1222 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 TIMP1P01033 207 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 GZMAP12544 262 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 RAG1P15918 1043 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF677Q86XU0 584 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 APBB2Q92870 758 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 CASD1Q96PB1 797 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD62A6NC57 917 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 GJB6O95452 261 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 CASQ1P31415 396 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF18AQ8NI77 898 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 NCK2O43639 380 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 PALMO75781 387 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 OR1G1P47890 313 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD7Q92527 254 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 BTBD6Q96KE9 485 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 CEP290O15078 2479 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 PIK3R2O00459 728 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 PAEPP09466 180 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM253P0C7T8 217 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 BCAR1P56945 870 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ABI1Q8IZP0 508 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF653Q96CK0 615 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 SNX25Q9H3E2 840 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 TULP2O00295 520 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 INPPL1O15357 1258 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 MICAL2O94851 1124 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 FTCDO95954 541 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC130P13994 396 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 CENPCQ03188 943 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 DSC1Q08554 894 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM7Q9C029 511 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-204ENST00000452765 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 O00370 1275 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 RRM1P23921 792 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 DNA2P51530 1060 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB103AP81534 67 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 IKBKEQ14164 716 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 SGO2Q562F6 1265 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 URGCPQ8TCY9 931 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 NOX5Q96PH1 765 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CDH23Q9H251 3354 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 M0QYV0 167 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TACC1O75410 805 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 GPC5P78333 572 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 PSMB7Q99436 277 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA0355O15063 1070 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 MON1BQ7L1V2 547 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 INTUQ9ULD6 942 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 SRGAP2O75044 1071 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 VDRP11473 427 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 ADORA2BP29275 332 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-204ENST00000452765 RABGGTBP53611 331 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms