RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 FAF2Q96CS3 445 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NSL1Q96IY1 281 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ECSITQ9BQ95 431 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 KCND1Q9NSA2 647 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SGCEO43556 437 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 INMTO95050 263 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF786Q8N393 782 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 WEE1P30291 646 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HSD17B2P37059 387 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 KRT31Q15323 416 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 STXBP2Q15833 593 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MAJINQ3KP22 176 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ACAD11Q709F0 780 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UNC13DQ70J99 1090 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ITIH5Q86UX2 942 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SATL1Q86VE3 508 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SLC29A1Q99808 456 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 CABP1Q9NZU7 370 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HESX1Q9UBX0 185 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 CHRNA3P32297 505 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 HERVK_113Q902F9 699 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 VPS51Q9UID3 782 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 RASGRP1O95267 797 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 THEGLP0DJG4 465 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 KCNA5P22460 613 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJB1P25685 340 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 EPHB2P29323 1055 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 IL12AP29459 219 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 GNA11P29992 359 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HAAOP46952 286 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 HSD17B4P51659 736 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CAPZA1P52907 286 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 ARID5AQ03989 594 aa5.82□□□□□ -1.48
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