RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436022.2

EFCC1-201, Transcript of EF-hand and coiled-coil domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene EFCC1, Length 2,691 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1-201ENST00000436022 STAG3L1P0CL83 205 aa23.52■■□□□ 1.36
EFCC1-201ENST00000436022 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.52■■□□□ 1.36
EFCC1-201ENST00000436022 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.52■■□□□ 1.36
EFCC1-201ENST00000436022 C6orf118Q5T5N4 469 aa23.52■■□□□ 1.36
EFCC1-201ENST00000436022 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
EFCC1-201ENST00000436022 PLVAPQ9BX97 442 aa23.52■■□□□ 1.36
EFCC1-201ENST00000436022 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ASAP2O43150 1006 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 TNNC2P02585 160 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 RALAP11233 206 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 CETPP11597 493 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 AUHQ13825 339 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 SURF1Q15526 300 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 CNPY4Q8N129 248 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 VTA1Q9NP79 307 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ADCY6O43306 1168 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 OGDHQ02218 1023 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 JADE1Q6IE81 842 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PRUNE1Q86TP1 453 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 MGARPQ8TDB4 240 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 SDCBP2Q9H190 292 aa23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 C5orf60A6NFR6 353 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PHKA2P46019 1235 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PARVAQ9NVD7 372 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 H3BRB1 525 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 DNM1LO00429 736 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 AGTP01019 485 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 SMPD1P17405 629 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 LRRC14Q15048 493 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 GPR142Q7Z601 462 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 MCEEQ96PE7 176 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PTPN18Q99952 460 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 GGA2Q9UJY4 613 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.5■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ITGB3P05106 788 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ITGA8P53708 1063 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 DENND1BQ6P3S1 775 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 C3orf20Q8ND61 904 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 CXorf38Q8TB03 319 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 TWNKQ96RR1 684 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 CYTH4Q9UIA0 394 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ANK1P16157 1881 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 TMEM191CA6NGB0 347 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 F8VP50 259 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 CREB1P16220 341 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 DPP9Q86TI2 863 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 LRRC34Q8IZ02 419 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 SCINQ9Y6U3 715 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.49■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ICE2Q659A1 982 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ADCY8P40145 1251 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 GTF2A2P52657 109 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 GPR162Q16538 588 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 DCLK3Q9C098 648 aa23.48■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 CD19P15391 556 aa23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 KYNUQ16719 465 aa23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 NLRP7Q8WX94 980 aa23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 CENPTQ96BT3 561 aa23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 SNF8Q96H20 258 aa23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 MAML3Q96JK9 1138 aa23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 PLXNB2O15031 1838 aa23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 FAM187BQ17R55 369 aa23.47■■□□□ 1.35
EFCC1-201ENST00000436022 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms