RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPOPLQ6IQ16 392 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF677Q86XU0 584 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RDH13Q8NBN7 331 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PEBP4Q96S96 227 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RUFY1Q96T51 708 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TIPINQ9BVW5 301 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NMUR2Q9GZQ4 415 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 WASF2Q9Y6W5 498 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0754O94854 1291 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CFBP00751 764 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STAT2P52630 851 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PQLC3Q8N755 202 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PLD5Q8N7P1 536 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf42Q96LP6 360 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS11Q9H270 941 aa3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 CST3P01034 146 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CAV1Q03135 178 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CYS1Q717R9 158 aa3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ISL2Q96A47 359 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL29Q96CT2 875 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MCRS1Q96EZ8 462 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TAAR1Q96RJ0 339 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDH9Q9HC56 1237 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ANAPC7Q9UJX3 599 aa3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 RIMBP2O15034 1052 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ADCY6O43306 1168 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PFKMP08237 780 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CLTAP09496 248 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL22P35268 128 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 PPM1KQ8N3J5 372 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 NMRK1Q9NWW6 199 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFATQ9P243 1243 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGC3Q9UN70 934 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA8IPA6NC78 632 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA8JA6NMD2 632 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CHMP2AO43633 222 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP10P09238 476 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 YWHABP31946 246 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EPS15P42566 896 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL34P49207 117 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMC5P62195 406 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC105Q8IYK2 499 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 JOSD2Q8TAC2 188 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM39BQ9GZU3 492 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GSC2O15499 205 aa3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 ADORA2AP29274 412 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEA12P43365 314 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC50Q8IVM0 306 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC17A8Q8NDX2 589 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RDM1Q8NG50 284 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ACCSQ96QU6 501 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF385DQ9H6B1 395 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SAR1AQ9NR31 198 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MOCS1Q9NZB8 636 aa3.83□□□□□ -1.8
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