RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 GPS1Q13098 491 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 TRABD2AQ86V40 505 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKLE1Q8NAG6 615 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF3Q9NR81 526 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 PARVAQ9NVD7 372 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ARID2Q68CP9 1835 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ANP32DO95626 131 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 NOP14P78316 857 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 VCPIP1Q96JH7 1222 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS37BQ9H9H4 285 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD2P08910 425 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 HARSP12081 509 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT15P19012 456 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 RTP1P59025 263 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTR2P61160 394 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ENPEPQ07075 957 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF43Q68DV7 783 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 TLDC1Q6P9B6 456 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 C4orf33Q8N1A6 199 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5B17Q8NGF7 314 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 SLITRK1Q96PX8 696 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC9A2Q9UBY0 812 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRIQ4A6NIV6 560 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 MSH2P43246 934 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 LMNB2Q03252 620 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 EMC2Q15006 297 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ASRGL1Q7L266 308 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 NSMCE1Q8WV22 266 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 TRABDQ9H4I3 376 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 EBF2Q9HAK2 575 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 IP6K2Q9UHH9 426 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ASMTLO95671 621 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ALADP13716 330 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 LBX2Q6XYB7 198 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 KIRREL3Q8IZU9 778 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MCEEQ96PE7 176 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 GLTPD2A6NH11 291 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 F8VP50 259 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBED8Q8IZ13 594 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 RCOR2Q8IZ40 523 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CCHCR1Q8TD31 782 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF606Q8WXB4 792 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 GRAMD1AQ96CP6 724 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MSTO1Q9BUK6 570 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 H0YCG3 227 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TJP3O95049 919 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNB1P01574 187 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 PLCB3Q01970 1234 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ASAP3Q8TDY4 903 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATC1LQ9H0A9 340 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ETNK1Q9HBU6 452 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 PHTF1Q9UMS5 762 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8SH3BPF8 625 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8MH3BSY2 632 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 BANF1O75531 89 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3D19Q5HYK7 790 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ALLCQ8N6M5 410 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXP3Q9BZS1 431 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MYLK2Q9H1R3 596 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO40Q9UH90 709 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 K7ERI5 159 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF394Q53GI3 561 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD15Q6UXT9 468 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP128Q6ZU80 1094 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ERO1BQ86YB8 467 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 FBF1Q8TES7 1133 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 GRID1Q9ULK0 1009 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 C15orf41Q9Y2V0 281 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM191CA6NGB0 347 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MAFGO15525 162 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM191BP0C7N4 346 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MMP8P22894 467 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ACVR2BQ13705 512 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 NCOA4Q13772 614 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 XRRA1Q6P2D8 792 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 DCUN1D2Q6PH85 259 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 DEPTORQ8TB45 409 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ERP27Q96DN0 273 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SMC6Q96SB8 1091 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM121Q9BTD3 319 aa19.68■□□□□ 0.74
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