RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 SLITRK1Q96PX8 696 aa25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 HEMGNQ9BXL5 484 aa25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 LONRF1Q17RB8 773 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 IZUMO3Q5VZ72 239 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 POLNQ7Z5Q5 900 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 TTC25Q96NG3 672 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 PPCSQ9HAB8 311 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 PNMA3Q9UL41 463 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 CENPFP49454 3210 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 RASSF9O75901 435 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 MAP2K2P36507 400 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 NR1H3Q13133 447 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 CRHR2Q13324 411 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 KYNUQ16719 465 aa25.13■■□□□ 1.61
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PMS1-205ENST00000409985 LRRC34Q8IZ02 419 aa25.13■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 ABLIM1O14639 778 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 MAPK6Q16659 721 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 C2CD6Q53TS8 623 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 ICE2Q659A1 982 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC24Q6P3W2 148 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
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PMS1-205ENST00000409985 CEP83Q9Y592 693 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 LRRC37A2A6NM11 1700 aa25.12■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 B4GALT4O60513 344 aa25.11■■□□□ 1.61
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PMS1-205ENST00000409985 FBXW10Q5XX13 1052 aa25.11■■□□□ 1.61
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PMS1-205ENST00000409985 CISHQ9NSE2 258 aa25.11■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 CPA4Q9UI42 421 aa25.11■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 O00370 1275 aa25.11■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 SLC26A2P50443 739 aa25.11■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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PMS1-205ENST00000409985 VSTM1Q6UX27 236 aa25.11■■□□□ 1.61
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PMS1-205ENST00000409985 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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PMS1-205ENST00000409985 HTTP42858 3142 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A27O95847 323 aa25.09■■□□□ 1.61
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PMS1-205ENST00000409985 MAGEA4P43358 317 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 TFDP1Q14186 410 aa25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 DCUN1D2Q6PH85 259 aa25.09■■□□□ 1.61
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