RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF516Q92618 1163 aa21.73■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC3Q9BY71 257 aa21.73■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.73■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.73■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 DMAC2Q9NW81 257 aa21.73■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 CA14Q9ULX7 337 aa21.73■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 NR3C1P04150 777 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 CASP4P49662 377 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 GPC5P78333 572 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 TMC8Q8IU68 726 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA18Q8TC71 538 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 ACBD6Q9BR61 282 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 ASB3Q9Y575 518 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 KRBA1A5PL33 1030 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 HCRTO43612 131 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 ECI2O75521 394 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF20AO95235 890 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 NPR3P17342 541 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 ATF6P18850 670 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 LHX1P48742 406 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNB1Q14721 858 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 VEPH1Q14D04 833 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 TEAD2Q15562 447 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 ITIH5Q86UX2 942 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMG2Q969U7 264 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PRU2 124 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 GABRDO14764 452 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 DPH6Q7L8W6 267 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PRSS33Q8NF86 280 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 ASB16Q96NS5 453 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 MMS19Q96T76 1030 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PHACTR2O75167 634 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 RFX1P22670 979 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 FCARP24071 287 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PCSK1P29120 753 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 CLCN5P51795 746 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 TRPC3Q13507 836 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PNOCQ13519 176 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC142Q17RM4 750 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP135Q66GS9 1140 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 GIPC2Q8TF65 315 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PKMYT1Q99640 499 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PRRX2Q99811 253 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 MUC6Q6W4X9 2439 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 STK25O00506 426 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 MYL6P60660 151 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 BIRC3Q13489 604 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF12Q16514 161 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 GAREM2Q75VX8 874 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 SMARCD2Q92925 531 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 SYT15Q9BQS2 421 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PI15O43692 258 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP2C2O75185 946 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 FGF19O95750 216 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 AOC1P19801 751 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 LMO2P25791 158 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 GABRR2P28476 465 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR15P49685 360 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 AP3M2P53677 418 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1382.5 ms