RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 AP1B1Q10567 949 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 NR1H3Q13133 447 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM72Q6ZMU5 477 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 FBXO41Q8TF61 875 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 MKL1Q969V6 931 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 LENG9Q96B70 501 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TSC22D3Q99576 134 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM4Q9C037 500 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CISHQ9NSE2 258 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ASNSD1Q9NWL6 643 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 STOML1Q9UBI4 398 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 DPEP1P16444 411 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TFDP2Q14188 446 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM71AQ8IYT1 594 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PAFAH2Q99487 392 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 IDI2Q9BXS1 227 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 VCX3BQ9H321 246 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 COL20A1Q9P218 1284 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CES2O00748 559 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 NDC80O14777 642 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP9BO43861 1147 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ITGB3P05106 788 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 KRT16P08779 473 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 BGNP21810 368 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 RCN1Q15293 331 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TTC13Q8NBP0 860 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SHC3Q92529 594 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PXMP2Q9NR77 195 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A1W2PPM1 405 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 KRT38O76015 456 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 GJB1P08034 283 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PYGBP11216 843 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SOX11P35716 441 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CXCL9Q07325 125 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ASPHQ12797 758 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 EML3Q32P44 896 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CRY2Q49AN0 593 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TCP10LQ8TDR4 215 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 EXT2Q93063 718 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 KIF12Q96FN5 646 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 POLIQ9UNA4 740 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ENTPD5O75356 428 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CCND1P24385 295 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 JAM2P57087 298 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ITIH4Q14624 930 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC6Q86X45 466 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ABRAQ8N0Z2 381 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 MTFR1LQ9H019 292 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SNX25Q9H3E2 840 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SPEF2Q9C093 1822 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ASAP2O43150 1006 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 HSPA4LO95757 839 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TYK2P29597 1187 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms