RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 TFF2Q03403 129 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 NOGQ13253 232 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 BMPR2Q13873 1038 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 LLGL1Q15334 1064 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLAC9Q5JTB6 97 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM240Q5SV17 173 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 CAMKK1Q8N5S9 505 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 RGMAQ96B86 450 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM136AQ96C01 138 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF778Q96MU6 729 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SERGEFQ9UGK8 458 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PADI4Q9UM07 663 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPEF1Q9Y4P9 236 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERBB2P04626 1255 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 EBLN1P0CF75 366 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHRM3P20309 590 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 EPHA10Q5JZY3 1008 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF618Q5T7W0 954 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR18Q8N4B5 295 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLHDC4Q8TBB5 520 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 DDB2Q92466 427 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM167AQ96KS9 214 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLAMF7Q9NQ25 335 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 SERHLQ9NQF3 203 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAD54BQ9Y620 910 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 TARM1B6A8C7 271 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 M0QYG6 137 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 LATS1O95835 1130 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 GNAI2P04899 355 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 TYRP14679 529 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 JUPP14923 745 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDCP20941 246 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 TBCCQ15814 346 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS53Q5VIR6 699 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 CEP85Q6P2H3 762 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD16Q6P6B7 361 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP37Q86T82 979 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 TBC1D5Q92609 795 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 NELL2Q99435 816 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 LMBRD1Q9NUN5 540 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 DKK3Q9UBP4 350 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 HESX1Q9UBX0 185 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABCF2Q9UG63 623 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 CADPSQ9ULU8 1353 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 WDR91A4D1P6 747 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF213O14771 459 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS4BO75351 444 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFB7P17568 137 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ITGB6P18564 788 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCND1P24385 295 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 PHKA1P46020 1223 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAP2K6P52564 334 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 EVA1CP58658 441 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 GRM1Q13255 1194 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 PROSER3Q2NL68 480 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 EMC10Q5UCC4 262 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM160B1Q5W0V3 765 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF425Q6IV72 752 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP45Q70EL2 814 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 DTX2Q86UW9 622 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 VGLL2Q8N8G2 317 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 REPS1Q96D71 796 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 SH2B3Q9UQQ2 575 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 H0YIZ8 118 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-601P-201ENST00000384540 TLR5O60602 858 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms