RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372478.4

C9orf50-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene C9orf50, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50-201ENST00000372478 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ZMYND10O75800 440 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 SEC24AO95486 1093 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 VNN2O95498 520 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 WARSP23381 471 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 LMO2P25791 158 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 LHX1P48742 406 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 UVSSAQ2YD98 709 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 SLC39A12Q504Y0 691 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 SPATA18Q8TC71 538 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 SDCBP2Q9H190 292 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ADAM7Q9H2U9 754 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 THAP9Q9H5L6 903 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 CYP4F11Q9HBI6 524 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 RAB20Q9NX57 234 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 PRRG1O14668 218 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 IL9P15248 144 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ELF1P32519 619 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 SNX25Q9H3E2 840 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 NME7Q9Y5B8 376 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 C5orf42Q9H799 3197 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 TACC1O75410 805 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 PDGFRBP09619 1106 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF165P49910 485 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 TSPY1Q01534 308 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 KCNH2Q12809 1159 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 CCDC142Q17RM4 750 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 PPM1LQ5SGD2 360 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 CES5AQ6NT32 575 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ATAD1Q8NBU5 361 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 CCDC150Q8NCX0 1101 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 OR6B3Q8NGW1 331 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ACBD6Q9BR61 282 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 COQ4Q9Y3A0 265 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 MTMR11A4FU01 709 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 P4HA1P13674 534 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ASPAP45381 313 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ITIH3Q06033 890 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 CRISPLD1Q9H336 500 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 TMLHEQ9NVH6 421 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ATP2C2O75185 946 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 AFPP02771 609 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 BMP1P13497 986 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 PCSK1P29120 753 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 DUSP4Q13115 394 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 GPR149Q86SP6 731 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 FAM114A1Q8IWE2 563 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 TCEAL8Q8IYN2 117 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 SYT15Q9BQS2 421 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 CCL16O15467 120 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 TTC9BQ8N6N2 239 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 SUSD6Q92537 303 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 NIF3L1Q9GZT8 377 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 GTF3C4Q9UKN8 822 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf50-201ENST00000372478 DOCK6Q96HP0 2047 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 FAM163BP0C2L3 166 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 WDR44Q5JSH3 913 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 TATDN2Q93075 761 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 PRKD2Q9BZL6 878 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 INSL5Q9Y5Q6 135 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 MYBPHLA2RUH7 354 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 A8MXQ7 604 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 TJAP1Q5JTD0 557 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 PKMYT1Q99640 499 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 LPIN3Q9BQK8 851 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 BCO2Q9BYV7 579 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 DPEP3Q9H4B8 488 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 PIDD1Q9HB75 910 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 CDH9Q9ULB4 789 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 FAM50BQ9Y247 325 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 KCNJ18B7U540 433 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 PMM2O15305 246 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
C9orf50-201ENST00000372478 LRMPQ12912 555 aa26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms