RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC89Q8N998 374 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC77Q9BR77 488 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 HEMGNQ9BXL5 484 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 PPME1Q9Y570 386 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 OGTO15294 1046 aa25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 PSTPIP1O43586 416 aa25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 POTEJP0CG39 1038 aa25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 RALAP11233 206 aa25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MCL1Q07820 350 aa25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 STAT4Q14765 748 aa25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNG2Q16589 344 aa25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa25.23■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXO6A8MYZ6 492 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 GJB1P08034 283 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CD58P19256 250 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 AP3M2P53677 418 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPK6Q16659 721 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ERO1BQ86YB8 467 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 RHOT1Q8IXI2 618 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL29Q96CT2 875 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC25A27O95847 323 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF365Q70YC5 407 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 RHPN2Q8IUC4 686 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 FITM2Q8N6M3 262 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 COPS5Q92905 334 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 GRAMD1AQ96CP6 724 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF3Q9NR81 526 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 USTQ9Y2C2 406 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 SCINQ9Y6U3 715 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MGAMO43451 1857 aa25.22■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CETPP11597 493 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MMP8P22894 467 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF43Q68DV7 783 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 KATNAL2Q8IYT4 538 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXC6P09630 235 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 BRD2P25440 801 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 VPS41P49754 854 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MTFR1Q15390 333 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP128Q6ZU80 1094 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA33Q96N06 139 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 PWWP2AQ96N64 755 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CISHQ9NSE2 258 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 PARVAQ9NVD7 372 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 EURLQ9NYK6 297 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL14Q9P2G3 628 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 TBK1Q9UHD2 729 aa25.21■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CXCL11O14625 94 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 GAS2O43903 313 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 PROZP22891 400 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 GJC1P36383 396 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 ACVR2BQ13705 512 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 MOGSQ13724 837 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 ACCSLQ4AC99 568 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF394Q53GI3 561 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 ASRGL1Q7L266 308 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM118BQ9BPY3 351 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXP3Q9BZS1 431 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 B4GALT5O43286 388 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 ABHD2P08910 425 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 TCF4P15884 667 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC15Q0P6D6 951 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 IZUMO3Q5VZ72 239 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 CGB2Q6NT52 195 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 AGAP11Q8TF27 550 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRHQ9HD43 1115 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 ANK1P16157 1881 aa25.2■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.19■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.19■■□□□ 1.62
AMIGO1-201ENST00000369862 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms