RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 LRRC6Q86X45 466 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 MZB1Q8WU39 189 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 NT5C1BQ96P26 610 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 KLF11O14901 512 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 XIAPP98170 497 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 GRAPQ13588 217 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 TBCCQ15814 346 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PCGF5Q86SE9 256 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 FBXO11Q86XK2 927 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ZNF677Q86XU0 584 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CCDC17Q96LX7 622 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CAPN14A8MX76 684 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ZBTB39O15060 712 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ATP9BO43861 1147 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 GRM2Q14416 872 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PREBQ9HCU5 417 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.3■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 H3BRJ5 948 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 MYL2P10916 166 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ARL4CP56559 192 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ITGA9Q13797 1035 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 HIF1AQ16665 826 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 MKL1Q969V6 931 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PANX3Q96QZ0 392 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PAFAH2Q99487 392 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 GPX6P59796 221 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ASPHQ12797 758 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CFAP157Q5JU67 520 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SMIM5Q71RC9 77 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 DAW1Q8N136 415 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 C1orf21Q9H246 121 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.29■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 MED21Q13503 144 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 TTC7BQ86TV6 843 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SPATA24Q86W54 205 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SEMA4DQ92854 862 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CHMP2AO43633 222 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 LPXNO60711 386 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ASLP04424 464 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 VAV1P15498 845 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 TSHRP16473 764 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 RGS2P41220 211 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ETV4P43268 484 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SLFN13Q68D06 897 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PDSS2Q86YH6 399 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 NARFQ9UHQ1 456 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CLUHO75153 1309 aa20.28■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.27■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 LGR5O75473 907 aa20.27■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 TMCC1O94876 653 aa20.27■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 TAS2R40P59535 323 aa20.27■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CDK18Q07002 472 aa20.27■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 LIN9Q5TKA1 542 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms