RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 LOC285556D6RIA3 1793 aa17.29■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 TCP11X1B4DZS4 312 aa17.29■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 PGK2P07205 417 aa17.29■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 CRYMQ14894 314 aa17.29■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC24Q6P3W2 148 aa17.29■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 HOMEZQ8IX15 550 aa17.29■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 SEPT1Q8WYJ6 367 aa17.29■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa17.29■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 RASSF9O75901 435 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 BRAFP15056 766 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 E2F5Q15329 346 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 SH3D19Q5HYK7 790 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM63BQ5T3F8 832 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 RCOR2Q8IZ40 523 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 PTPRFP10586 1907 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 ABLIM1O14639 778 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 B4GALT5O43286 388 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 PRKCBP05771 671 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 EDNRBP24530 442 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 ORC1Q13415 861 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 FAM160B1Q5W0V3 765 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 C10orf88Q9H8K7 445 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 KLC4Q9NSK0 619 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 GPRC5DQ9NZD1 345 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 SAMD15Q9P1V8 674 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 POLIQ9UNA4 740 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 ZBTB42B2RXF5 422 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 MAGEA4P43358 317 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 RAP1GAPP47736 663 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 PLCB4Q15147 1175 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 DUOXA2Q1HG44 320 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 CAPN12Q6ZSI9 719 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 RHPN2Q8IUC4 686 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 ANKS4BQ8N8V4 417 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 NIF3L1Q9GZT8 377 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 KDM4CQ9H3R0 1056 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 EVPLQ92817 2033 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 GOLGA8SH3BPF8 625 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 OGTO15294 1046 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 ARSEP51690 589 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 TRPC3Q13507 836 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 METTL7BQ6UX53 244 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM192Q8IY95 271 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 SAYSD1Q9NPB0 183 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-201ENST00000325599 MCM3APO60318 1980 aa17.27■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 LRRD1A4D1F6 860 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 CALB1P05937 261 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 HOXC6P09630 235 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 GPS1Q13098 491 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 DENND1BQ6P3S1 775 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 GADL1Q6ZQY3 521 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 ERICH1Q86X53 443 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM35BQ8NCS4 154 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM121Q9BTD3 319 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 ABCF3Q9NUQ8 709 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 ETAA1Q9NY74 926 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GUA9 196 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 TJP3O95049 919 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 ASPAP45381 313 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 EFNA5P52803 228 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 MAPK6Q16659 721 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 SMTNL2Q2TAL5 461 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 WDR72Q3MJ13 1102 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 EEF1DP3Q658K8 133 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 NUGGCQ68CJ6 796 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 NLRP4Q96MN2 994 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 XYLT2Q9H1B5 865 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 CYTH4Q9UIA0 394 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 SNX3O60493 162 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 CDH8P55286 799 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 DYNLT1P63172 113 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF699Q32M78 642 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 KCNT1Q5JUK3 1230 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 IER5Q5VY09 327 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 BBOF1Q8ND07 529 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 ARMC2Q8NEN0 867 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 ADAM33Q9BZ11 813 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-201ENST00000325599 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms