RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 DCAF4Q8WV16 495 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 CST8O60676 142 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 PROSCO94903 275 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 BPIFB4P59827 614 aa25.12■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.12■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 ZNF711Q9Y462 761 aa25.12■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 MPP4Q96JB8 637 aa25.11■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 VAV3Q9UKW4 847 aa25.1■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.09■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.09■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 ECE1P42892 770 aa25.09■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 RTP1P59025 263 aa25.09■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.09■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 CCDC33Q8N5R6 958 aa25.09■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 NRLP54845 237 aa25.08■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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PACS2-201ENST00000325438 LRRN4Q8WUT4 740 aa25.08■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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