RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 LRRC6Q86X45 466 aa22.87■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 TIPINQ9BVW5 301 aa22.87■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.87■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 LRRD1A4D1F6 860 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 TJP3O95049 919 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ATP6V1C1P21283 382 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 PTPN4P29074 926 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 MORF4L2Q15014 288 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 CENPUQ71F23 418 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 USP37Q86T82 979 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SYT15Q9BQS2 421 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 CNTNAP1P78357 1384 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 C2CD2LO14523 706 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 LMNB2Q03252 620 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ZNF394Q53GI3 561 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 PARVAQ9NVD7 372 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 MARK3P27448 753 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SLC18A1P54219 525 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 BPIFB4P59827 614 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 HIF1AQ16665 826 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.85■■□□□ 1.25
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ELL3-201ENST00000319359 PAFAH2Q99487 392 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 HEY2Q9UBP5 337 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SPDYE6P0CI01 402 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 CHRNA5P30532 468 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 LIG4P49917 911 aa22.85■■□□□ 1.25
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ELL3-201ENST00000319359 RMDN3Q96TC7 470 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SCINQ9Y6U3 715 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ZBED4O75132 1171 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 KRT36O76013 467 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 WASHC2DQ5SRD0 308 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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ELL3-201ENST00000319359 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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ELL3-201ENST00000319359 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SENP1Q9P0U3 644 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 EXTL3O43909 919 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 GARTP22102 1010 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ERFP50548 548 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 JAK3P52333 1124 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 FYB2Q5VWT5 728 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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ELL3-201ENST00000319359 STBD1O95210 358 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 RASSF2P50749 326 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 SATB1Q01826 763 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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ELL3-201ENST00000319359 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 RFX8Q6ZV50 586 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 TTC7BQ86TV6 843 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 MZB1Q8WU39 189 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-201ENST00000319359 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.83■■□□□ 1.25
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