RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307407.7

CXCL8-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 8, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL8, Length 1,705 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL8-201ENST00000307407 ACAP3Q96P50 834 aa6.9□□□□□ -1.3
CXCL8-201ENST00000307407 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CXCL8-201ENST00000307407 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.9□□□□□ -1.3
CXCL8-201ENST00000307407 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.9□□□□□ -1.3
CXCL8-201ENST00000307407 HIPK3Q9H422 1215 aa6.9□□□□□ -1.3
CXCL8-201ENST00000307407 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.9□□□□□ -1.3
CXCL8-201ENST00000307407 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.9□□□□□ -1.3
CXCL8-201ENST00000307407 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
CXCL8-201ENST00000307407 CITO14578 2027 aa6.9□□□□□ -1.3
CXCL8-201ENST00000307407 PTPRJQ12913 1337 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 EPHB6O15197 1021 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 STX10O60499 249 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 NFICP08651 508 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 KRT19P08727 400 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 CLTAP09496 248 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 PBX1P40424 430 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 PIK3CAP42336 1068 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 CETN1Q12798 172 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 FAM26DQ5JW98 314 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 UBXN11Q5T124 520 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 KRT39Q6A163 491 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 JADE1Q6IE81 842 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 GJB7Q6PEY0 223 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 CAGE1Q8TC20 777 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 CGRRF1Q99675 332 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 ADAM2Q99965 735 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 IPPQ9Y573 584 aa6.9□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 A0A1W2PQC6 194 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TTC26A0AVF1 554 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 NBNO60934 754 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 CAND2O75155 1236 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 RECQL4O94761 1208 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 MAP3K6O95382 1288 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TNNC2P02585 160 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 GYPCP04921 128 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 CLTBP09497 229 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 COL6A1P12109 1028 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 PON1P27169 355 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 GUCY2FP51841 1108 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 PERM1Q5SV97 790 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 RRAGAQ7L523 313 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 SEMA4DQ92854 862 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 CEP41Q9BYV8 373 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TMX1Q9H3N1 280 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 ZNF358Q9NW07 568 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.89□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 IL18RAPO95256 599 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 HLA-DRAP01903 254 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 ITGA4P13612 1032 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 NFKB1P19838 968 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 KRT9P35527 623 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 MLH1P40692 756 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 USP8P40818 1118 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 EPHA4P54764 986 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 ARID5AQ03989 594 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TRPC3Q13507 836 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 SURF1Q15526 300 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 KYAT1Q16773 422 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.88□□□□□ -1.31
CXCL8-201ENST00000307407 WDR49Q8IV35 697 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms