RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 A8MXQ7 604 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 GLP2RO95838 553 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CD58P19256 250 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CDR1P51861 262 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 KCNC3Q14003 757 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ARID3AQ99856 593 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 SLC9A1P19634 815 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 LILRA6Q6PI73 481 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CASP10Q92851 521 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 NME7Q9Y5B8 376 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ABLIM3O94929 683 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 GPR17Q13304 367 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CUL2Q13617 745 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 TPGS2Q68CL5 300 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 RNF214Q8ND24 703 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 SYT15Q9BQS2 421 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CDH9Q9ULB4 789 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ATP2C2O75185 946 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 TBX10O75333 385 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PON1P27169 355 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ELF1P32519 619 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ADCY1Q08828 1119 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 COL19A1Q14993 1142 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 RRAGAQ7L523 313 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 DPP7Q9UHL4 492 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRDP23468 1912 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 C1RP00736 705 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ATF2P15336 505 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 LTBRP36941 435 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 NDST1P52848 882 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 LIN9Q5TKA1 542 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 HLA-CQ95604 372 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CISHQ9NSE2 258 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 LGALS16A8MUM7 142 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PRRG1O14668 218 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 SERPINC1P01008 464 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 APBA1Q02410 837 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 UBXN1Q04323 297 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 INCA1Q0VD86 236 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ORC1Q13415 861 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC142Q17RM4 750 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 CLEC1BQ9P126 229 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 C5orf42Q9H799 3197 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 MTMR11A4FU01 709 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 KCNA5P22460 613 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 FILIP1LQ4L180 1135 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF394Q53GI3 561 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 GJB7Q6PEY0 223 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 UNC93AQ86WB7 457 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 TTC39CQ8N584 583 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 KAT5Q92993 513 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 TNIP3Q96KP6 325 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 APOL5Q9BWW9 433 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 DZANK1Q9NVP4 752 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD4-201ENST00000306324 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms