RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPA1P27694 616 aa18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PSMC6P62333 389 aa18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCNG2Q16589 344 aa18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ULK2Q8IYT8 1036 aa18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM172AQ8WUF8 416 aa18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MRIQ9BWK5 157 aa18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SH3GLB1Q9Y371 365 aa18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATRNL1Q5VV63 1379 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RSPH10B2B2RC85 870 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RSPH10BP0C881 870 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADSSP30520 456 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADARP55265 1226 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CBX3Q13185 183 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LLGL1Q15334 1064 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 P3H1Q32P28 736 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RFX8Q6ZV50 586 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCDH18Q9HCL0 1135 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CAPN14A8MX76 684 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 H3BRJ5 948 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VILLO15195 856 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR6B1O95007 311 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIM49P0CI25 452 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIM49CP0CI26 452 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHN2P52757 468 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NFIAQ12857 509 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHSY1Q86X52 802 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EPS8L1Q8TE68 723 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC5A5Q92911 643 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HERPUD2Q9BSE4 406 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DMAC2Q9NW81 257 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STK24Q9Y6E0 443 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FOCADQ5VW36 1801 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBE4BO95155 1302 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STAT3P40763 770 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPL5P46777 297 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPIRE1Q08AE8 756 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EFHC2Q5JST6 749 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C1orf146Q5VVC0 180 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTC7BQ86TV6 843 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MBOAT7Q96N66 472 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYH11P35749 1972 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NFASCO94856 1347 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR91A4D1P6 747 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NDC80O14777 642 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP1O94782 785 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDK4P11802 303 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VCLP18206 1134 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CYP3A7P24462 503 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GTF2H1P32780 548 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLCN2P51788 898 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GABPAQ06546 454 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCP10LQ8TDR4 215 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MTBPQ96DY7 904 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CYTH2Q99418 400 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NMUR2Q9GZQ4 415 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP29Q9HBJ7 922 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMIM18P0DKX4 95 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CACNB3P54284 484 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARL4CP56559 192 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TGFB2P61812 414 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PHEXP78562 749 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BFSP1Q12934 665 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAP7D3Q8IWC1 876 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMYD1Q8NB12 490 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEP95Q96GE4 821 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C1orf21Q9H246 121 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VPS37BQ9H9H4 285 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 S100A14Q9HCY8 104 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms