RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 AMHP03971 560 aa24.13■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 LMO2P25791 158 aa24.13■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 GALCP54803 685 aa24.13■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 DEFB103AP81534 67 aa24.13■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.13■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.13■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.13■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 I3L4J1 428 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 M0QZQ0 153 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 GABRDO14764 452 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 MED7O43513 233 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 BAIAP3O94812 1187 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.451e-6■■■□□ 18
UFD1-201ENST00000263202 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 ACOT1Q86TX2 421 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 PASD1Q8IV76 773 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 HCSTQ9UBK5 93 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 NOMO3P69849 1222 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 FPGSQ05932 587 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 SGO2Q562F6 1265 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 SUSD3Q96L08 255 aa24.12■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 ANKRD62A6NC57 917 aa24.11■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 PDGFRBP09619 1106 aa24.11■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 ODC1P11926 461 aa24.11■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 LRRC43Q8N309 656 aa24.11■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 C12orf29Q8N999 325 aa24.11■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 NRP1O14786 923 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 CYP11A1P05108 521 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 TMEM253P0C7T8 217 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 CENPCQ03188 943 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 CNGA2Q16280 664 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 NAA35Q5VZE5 725 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 O00370 1275 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 ABCB4P21439 1286 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 LHX1P48742 406 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 THAP2Q9H0W7 228 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.1■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 ALDH2P05091 517 aa24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 TNNT1P13805 278 aa24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 SLC11A1P49279 550 aa24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 SPATA18Q8TC71 538 aa24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 LHX5Q9H2C1 402 aa24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 KIF5CO60282 957 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 MICAL2O94851 1124 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 FGBP02675 491 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 ETF1P62495 437 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 ZNF365Q70YC5 407 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 TNIP3Q96KP6 325 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 DSEQ9UL01 958 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 MYH10P35580 1976 aa24.08■■□□□ 1.45
UFD1-201ENST00000263202 VWA8A3KMH1 1905 aa24.08■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 GALTP07902 379 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 SYN1P17600 705 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 STILQ15468 1287 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 CWH43Q9H720 699 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 TADA2AO75478 443 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 EPHB4P54760 987 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 GNG11P61952 73 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.07■■□□□ 1.44
UFD1-201ENST00000263202 METTL23Q86XA0 190 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms