RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Diaph3Q9Z207 1171 aa23.23■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm3460E9QAI8 215 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RarbP22605 482 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nudt16Q6P3D0 195 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mcph1Q7TT79 822 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q80ZQ3 298 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb44Q8R0A2 453 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rabgef1Q9JM13 491 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adgrf2E9Q4J9 644 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GclmO09172 274 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mmp10O55123 476 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ly9Q01965 654 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zscan2Q07230 614 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb14Q08376 449 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Neto2Q8BNJ6 525 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lars2Q8VDC0 902 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpa1Q8VEE4 623 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdha10Q91Y20 946 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa23.22■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam155bA2BDP1 471 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Magea1O89006 320 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prr18Q6PAN7 307 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klhdc10Q6PAR0 439 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HpseQ6YGZ1 535 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Glra2Q7TNC8 452 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cpa1Q7TPZ8 419 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 March4Q80TE3 409 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf879Q8BI99 563 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Taf5Q8C092 801 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adrm1Q9JKV1 407 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Magea2Q9R2A2 320 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Itpripl1A2ASA8 547 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm6588E9Q3K0 461 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdh9F8VPK8 1237 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf112Q0VAW7 879 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem63bQ3TWI9 832 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ugt3a1Q3UP75 523 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ddhd1Q80YA3 547 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Taf2Q8C176 1104 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mrpl58Q8R035 206 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsc1a1Q9ER99 582 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kifc1Q9QWT9 674 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa23.21■■□□□ 1.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm16430A6X8J1 155 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Unc5cO08747 931 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 E2f6O54917 272 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mmp13P33435 472 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cxcr2P35343 359 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdh8P97291 799 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp11aP98197 1187 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shroom1Q5SX79 823 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gpatch2lQ6PE65 482 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc39a13Q8BZH0 361 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Epn3Q91W69 636 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nek8Q91ZR4 698 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc39a3Q99K24 317 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slxl1Q9D515 155 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trpc3Q9QZC1 836 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hao1Q9WU19 370 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10801F7C7Q0 168 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ebf2O08792 575 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tspyl1O88852 379 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AmhP27106 555 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sash1P59808 1230 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc110Q3V125 848 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vps72Q62481 368 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nlrp4aQ8BU40 982 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adgra1Q8C4G9 578 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cry2Q9R194 592 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa23.2■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Clk2O35491 499 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RcvrnP34057 202 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mylk3Q3UIZ8 795 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam185aQ7TPD2 378 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mical2Q8BML1 960 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gtpbp10Q8K013 366 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bag2Q91YN9 210 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Terb2Q9D494 218 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm6583E9Q8Z1 469 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pms2P54279 859 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gbp8Q2V6D6 525 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Syt15Q8C6N3 418 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc8cQ8R502 803 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NelfcdQ922L6 591 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp26Q99MX1 835 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cntnap4Q99P47 1310 aa23.19■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MafgO54790 162 aa23.18■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppargc1aO70343 797 aa23.18■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gbp1Q01514 589 aa23.18■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PterQ60866 349 aa23.18■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif11Q6P9P6 1052 aa23.18■■□□□ 1.3
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RimklbQ80WS1 387 aa23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36 ms