RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Uchl4P58321 233 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp957Q3UT76 567 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm13103Q4VAD2 491 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Baiap3Q80TT2 1134 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wnk4Q80UE6 1222 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpc3Q8CFZ4 579 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 UvragQ8K245 698 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmco4Q91WU4 631 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snx29Q9D3S3 818 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dusp21Q9D9D8 189 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scyl3Q9DBQ7 735 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trpc2Q9R244 1172 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Akt3Q9WUA6 479 aa10.79□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tubb1A2AQ07 451 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm7995L7N2E4 160 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Casq2O09161 415 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Edil3O35474 480 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chmp6P0C0A3 200 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serpinb2P12388 415 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Shox2P70390 331 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gucy2gQ6TL19 1100 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ItpkaQ8R071 459 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Epn3Q91W69 636 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prmt7Q922X9 692 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Xpo6Q924Z6 1125 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dpp3Q99KK7 738 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mcrs1Q99L90 462 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cuedc2Q9CXX9 284 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mageb3Q9D2H4 330 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chst7Q9EP78 484 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc5a4aQ9ET37 656 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nlrc4Q3UP24 1024 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5168Q4KL04 211 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Syn2Q64332 586 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wdr44Q6NVE8 915 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Uts2bQ765I1 113 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Daam2Q80U19 1115 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kctd12bQ8C7J6 292 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mettl24Q8CCB5 363 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kctd15Q8K0E1 283 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CarfQ8VHI4 689 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trpv6Q91WD2 767 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sec14l2Q99J08 403 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Med7Q9CZB6 233 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf4Q9QZS2 194 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt71Q9R0H5 524 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Phf2Q9WTU0 1096 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Anapc7Q9WVM3 565 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pck1Q9Z2V4 622 aa10.78□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cntnap4Q99P47 1310 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1305A2AVW3 312 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acp4D3YTS9 425 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmigd3G3X8R9 209 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SprtnG3X912 497 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CopeO89079 308 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scp2P32020 547 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SftpdP50404 374 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccr5P51682 354 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Psmc1P62192 440 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dpysl3Q62188 570 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tpd52Q62393 224 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf185Q62394 352 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prmt6Q6NZB1 378 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Inpp4bQ6P1Y8 924 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HpseQ6YGZ1 535 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr23Q7TRX4 325 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grik4Q8BMF5 956 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc9a4Q8BUE1 797 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Phka2Q8BWJ3 1235 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Btbd9Q8C726 612 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Uba6Q8C7R4 1053 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp446Q8C9M8 523 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd300ldQ8VCH2 221 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PolkQ9QUG2 852 aa10.77□□□□□ -0.68
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ThadaA8C756 1938 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wfdc16A2A5H4 111 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcng1A2BDX4 514 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adgrf2E9Q4J9 644 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm8909G3UXE9 396 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zc3h12bG3X9I7 835 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10721J3QPJ9 223 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif5cP28738 956 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Oaz1P54369 227 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Psmc4P54775 418 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Creb1Q01147 341 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 VcpQ01853 806 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aars2Q14CH7 980 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tars2Q3UQ84 723 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lipo3Q3UT41 399 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa10.77□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 WtipQ7TQJ8 398 aa10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42 ms