RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf225Q9D7D1 332 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpatch1Q9DBM1 930 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ErmapQ9JLN5 566 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ggt5Q9Z2A9 573 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syngap1F6SEU4 1340 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh8P97291 799 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neto2Q8BNJ6 525 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Naa25Q8BWZ3 972 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prmt7Q922X9 692 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc74aA0A1Y7VMD6 494 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxc6P10629 235 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yipf3Q3UDR8 347 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syne3Q4FZC9 975 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Retreg2Q6NS82 541 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stkld1Q80YS9 662 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Qsox1Q8BND5 748 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc7a14Q8BXR1 771 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpc3Q9QZC1 836 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PcntP48725 2898 aa13.35□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt19P19001 403 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bmp2P21274 394 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tap2P36371 702 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnq1P97414 668 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oas1fQ14AZ4 364 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grm2Q14BI2 872 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr41Q3UDP0 460 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sema5aQ62217 1077 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Six1Q62231 284 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uts2bQ765I1 113 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nim1kQ8BHI9 436 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Inpp5fQ8CDA1 1132 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cog3Q8CI04 820 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cwf19l1Q8CI33 537 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl36Q8R124 613 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lpgat1Q91YX5 370 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtsqQ91ZF4 343 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec14l2Q99J08 403 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rap1gds1E9Q912 607 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kng1O08677 661 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GzmgP13366 248 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tulp2P46686 562 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vamp7P70280 220 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrkczQ02956 592 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hace1Q3U0D9 909 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp2r5eQ61151 467 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp4fQ66X05 959 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PoliQ6R3M4 717 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nacc1Q7TSZ8 514 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C130026I21RikQ8C898 291 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kct2Q8K201 259 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trib2Q8K4K3 343 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HibchQ8QZS1 385 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vopp1Q8R1C3 172 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scrn2Q8VCA8 425 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IkbipQ9DBZ1 373 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pidd1Q9ERV7 915 aa13.34□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgsl1H3BL40 1073 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17535J3KMR8 224 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Marcksl1P28667 200 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nfe2Q07279 373 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf865Q3U3I9 1058 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bpifb5Q3UQ05 490 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SpdyaQ5IBH7 310 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SnphQ80U23 495 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ero1aQ8R180 464 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NcaldQ91X97 193 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thumpd2Q9CZB3 528 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wfdc1Q9ESH5 211 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Efcab12V9GXH0 673 aa13.33□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13084A2A8N0 494 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apol8A2VDH7 339 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc73B2RWC4 316 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10801F7C7Q0 168 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Casp14O89094 257 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scp2P32020 547 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ChukQ60680 745 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vav2Q60992 868 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ksr1Q61097 873 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fscn1Q61553 493 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec23ipQ6NZC7 998 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gja6Q6S5G4 283 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem260Q8BMD6 703 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actl9Q8CG27 415 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgfr1op2Q9CRA9 253 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Golga1Q9CW79 758 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9DA42 136 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rfx5Q9JL61 658 aa13.33□□□□□ -0.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.9 ms