RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeastyeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2YML013W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
UBX2YML013W SFH5P47008 294 aa4.74□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YIP1P53039 248 aa4.74□□□□□ -1.65
UBX2YML013W DYN2Q02647 92 aa4.74□□□□□ -1.65
UBX2YML013W INP1Q03694 420 aa4.74□□□□□ -1.65
UBX2YML013W LOA1Q06508 300 aa4.74□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W ARC40P38328 384 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YPT35P38815 214 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W HSP10P38910 106 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YEA6P39953 335 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MST27P53176 234 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W ALG13P53178 202 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MTM1P53320 366 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W BOR1P53838 576 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W BUD25P85052 153 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MRX8Q05473 314 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W TAZ1Q06510 381 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YCR075W-AQ3E830 75 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W ODC2Q99297 307 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YPR096CO13587 100 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W POR1P04840 283 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W COX9P07255 59 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MCH2P36032 473 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YCR041WP37265 110 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YBR292CP38357 123 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W FLO5P38894 1075 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W HMF1P40037 129 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W BAT2P47176 376 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YGR015CP53208 328 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W PDR17P53844 350 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RNH201P53942 307 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W BET5Q03630 159 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W SCW10Q04951 389 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W GAT3Q07928 141 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YOL024WQ08172 172 aa4.73□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W SPT15P13393 240 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W ERG4P25340 473 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RPS2P25443 254 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W OCH1P31755 480 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W QRI5P32344 111 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MRP49P32388 137 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W PAU16P35994 123 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W MCR1P36060 302 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W SIM1P40472 476 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YPL062WQ02781 134 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YMR166CQ03829 368 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W YDL218WQ07629 317 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W THI72Q08579 599 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W VPS13Q07878 3144 aa4.72□□□□□ -1.65
UBX2YML013W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W CPT1P17898 393 aa4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W SLM6P38343 150 aa4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YEA4P40004 342 aa4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YJR015WP47090 510 aa4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W APS2Q00381 147 aa4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W FSH2Q05015 223 aa4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YPR114WQ06107 315 aa4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W FRE8Q12209 686 aa4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
UBX2YML013W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W SEC4P07560 215 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YOL162WP0CF19 215 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YKL102CP34249 101 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W UMP1P38293 148 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W RPB11P38902 120 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YIL012WP40551 113 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W TTI2P47168 421 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W ERG25P53045 309 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W EMC4P53073 190 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W MMS2P53152 137 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W THI74Q04083 370 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W DIC1Q06143 298 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W ADH1P00330 348 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YCR007CP25354 239 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YER134CP40081 178 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W GPI14P47088 403 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W CDH1P53197 566 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W PAU4P53427 120 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W SYM1Q06563 197 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YPR011CQ12251 326 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W YOS1Q3E834 85 aa4.7□□□□□ -1.66
UBX2YML013W PAU1P0CE88 120 aa4.69□□□□□ -1.66
UBX2YML013W PAU14P0CE89 120 aa4.69□□□□□ -1.66
UBX2YML013W PAU6P0CE90 120 aa4.69□□□□□ -1.66
UBX2YML013W PAU18P0CE91 120 aa4.69□□□□□ -1.66
UBX2YML013W PAU8P0CE92 120 aa4.69□□□□□ -1.66
UBX2YML013W PAU11P0CE93 120 aa4.69□□□□□ -1.66
UBX2YML013W DPM1P14020 267 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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