RNA–Protein interactions for RNA: YHR058C

MED6, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene MED6, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MED6	YHR058C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	MED8	P38304	223 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	RMD6	P39975	231 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	RRG9	P40156	214 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	SPC3	Q12133	184 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	MSW1	P04803	379 aa		5	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	SIR2	P06700	562 aa		5	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	MRPS28	P21771	286 aa		5	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	PEX22	P39718	180 aa		5	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	FIP1	P45976	327 aa		5	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	UFD1	P53044	361 aa		5	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	MRS1	P07266	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	UBC8	P28263	218 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	YKR041W	P36134	250 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	FAR7	P43592	221 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	DYN2	Q02647	92 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	LIP2	Q06005	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	HAC1	P41546	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	STB1	P42845	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	YNL033W	P53964	284 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	YNL019C	P53975	284 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	AIM36	Q03798	255 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	RAV2	Q03956	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	PET8	P38921	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	GLE2	P40066	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	GON7	P46984	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	LCB3	P47013	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	GPI17	Q04080	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MED6	YHR058C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	CDC50	P25656	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	OAC1	P32332	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	SRY1	P36007	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	AIM25	P47140	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YML108W	Q03759	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	GPI11	Q06636	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	NVJ1	P38881	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YGL101W	P53144	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	MRX11	Q03079	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	OSW1	Q08692	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	FCY2	P17064	533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YCR023C	P25351	611 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	FUN26	P31381	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	APS1	P35181	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	RPA43	P46669	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	TOS8	P53147	276 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YGL034C	P53186	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	FSH2	Q05015	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	SNF4	P12904	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	ARO7	P32178	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	TFC1	P32367	649 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	AUA1	P32450	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
MED6	YHR058C	NAT2	P37293	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	PIR5	P46999	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	HHT1	P61830	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	ATG22	P25568	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	LDS1	P31379	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	FRM2	P37261	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YGR018C	P53211	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YNL184C	P53876	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	UBC7	Q02159	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	SGA1	P08019	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	AHC2	P25649	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	OCH1	P31755	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	HOT13	P36078	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	MIX23	P38162	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	TIR3	P40552	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	YMD8	Q03697	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED6	YHR058C	KIN28	P06242	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED6	YHR058C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.1 ms