RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W SRB6P32570 121 aa7.19□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YGR151CP53287 111 aa7.19□□□□□ -1.26
DDI1YER143W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W SPO13P23624 291 aa7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W CNB1P25296 175 aa7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W DAL3P32459 195 aa7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YBL059WP34224 193 aa7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W SHB17P36136 271 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W GNP1P48813 663 aa7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W AVO2Q04749 426 aa7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W MCH1Q07376 486 aa7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W POM34Q12445 299 aa7.18□□□□□ -1.26
DDI1YER143W ECM25P32525 599 aa7.17□□□□□ -1.26
DDI1YER143W QDR3P38227 689 aa7.17□□□□□ -1.26
DDI1YER143W LST8P41318 303 aa7.17□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YJL163CP46996 555 aa7.17□□□□□ -1.26
DDI1YER143W BNA1P47096 177 aa7.17□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YIP1P53039 248 aa7.17□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YMR166CQ03829 368 aa7.17□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YHP1Q04116 353 aa7.17□□□□□ -1.26
DDI1YER143W ARR3Q06598 404 aa7.17□□□□□ -1.26
DDI1YER143W QCR9P22289 66 aa7.16□□□□□ -1.26
DDI1YER143W SMD3P43321 101 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DDI1YER143W WWM1P43582 211 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YJR015WP47090 510 aa7.16□□□□□ -1.26
DDI1YER143W BOR1P53838 576 aa7.16□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YMR007WQ03675 126 aa7.16□□□□□ -1.26
DDI1YER143W TDH1P00360 332 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DDI1YER143W TOM40P23644 387 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DDI1YER143W FPR2P32472 135 aa7.15□□□□□ -1.26
DDI1YER143W NOP16P40007 231 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DDI1YER143W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YMR253CQ04835 414 aa7.15□□□□□ -1.26
DDI1YER143W CTR3Q06686 241 aa7.15□□□□□ -1.26
DDI1YER143W RAD28Q12021 506 aa7.15□□□□□ -1.26
DDI1YER143W JID1Q12350 301 aa7.15□□□□□ -1.26
DDI1YER143W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YAR068WP39564 161 aa7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PIC2P40035 300 aa7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PUS4P48567 403 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YGR018CP53211 109 aa7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W POS5Q06892 414 aa7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W NDE2Q07500 545 aa7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W RKI1Q12189 258 aa7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PCC1Q3E833 88 aa7.14□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PHO85P17157 305 aa7.13□□□□□ -1.27
DDI1YER143W RAD23P32628 398 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YPT31P38555 223 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YFL054CP43549 646 aa7.13□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU4P53427 120 aa7.13□□□□□ -1.27
DDI1YER143W CAF40P53829 373 aa7.13□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YMR316C-AI2HB70 103 aa7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PIS1P06197 220 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YCR022CP25620 114 aa7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W RIB5P38145 238 aa7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W CSH1P38287 376 aa7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W BDH1P39714 382 aa7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W LSM4P40070 187 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W GPP2P40106 250 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W MIC27P50945 234 aa7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YAP1802P53309 568 aa7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W SNO1Q03144 224 aa7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W SHH3Q04487 196 aa7.12□□□□□ -1.27
DDI1YER143W ILV5P06168 395 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YCL042WP25572 119 aa7.11□□□□□ -1.27
DDI1YER143W RPB9P27999 122 aa7.11□□□□□ -1.27
DDI1YER143W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YBL071CP38185 102 aa7.11□□□□□ -1.27
DDI1YER143W DER1P38307 211 aa7.11□□□□□ -1.27
DDI1YER143W POG1P40473 351 aa7.11□□□□□ -1.27
DDI1YER143W TAX4P47030 604 aa7.11□□□□□ -1.27
DDI1YER143W ERV2Q12284 196 aa7.11□□□□□ -1.27
DDI1YER143W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU1P0CE88 120 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU14P0CE89 120 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU6P0CE90 120 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU18P0CE91 120 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU8P0CE92 120 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU11P0CE93 120 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU13P38725 120 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU10Q03050 120 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YML122CQ03207 126 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU20Q08322 120 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W YOR352WQ08816 343 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PAU9Q3E770 120 aa7.1□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PHS1P40857 217 aa7.09□□□□□ -1.27
DDI1YER143W SAS2P40963 338 aa7.09□□□□□ -1.27
DDI1YER143W LST7P53237 242 aa7.09□□□□□ -1.27
DDI1YER143W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.5 ms