RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-208ENST00000620466 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 STAT5BP51692 787 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 SKOR1P84550 965 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 CUL3Q13618 768 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TKFCQ3LXA3 575 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 C2CD6Q53TS8 623 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 PPCSQ9HAB8 311 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 NR3C2P08235 984 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 RARGP13631 454 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TBCCQ15814 346 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 SPATA20Q8TB22 786 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 RASSF10A6NK89 507 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 PFDN1O60925 122 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ERFP50548 548 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 MTM1Q13496 603 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 CUL2Q13617 745 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 KRT80Q6KB66 452 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 KIF12Q96FN5 646 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 CLMNQ96JQ2 1002 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 GMCL1Q96IK5 515 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ACAP3Q96P50 834 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 DFFAO00273 331 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 RIPK2O43353 540 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 PYGLP06737 847 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 NNMTP40261 264 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 AMPD2Q01433 879 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 KCNMA1Q12791 1236 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 DNAJC3Q13217 504 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TEX9Q8N6V9 391 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 MRC1P22897 1456 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 FAM86B1E9PN63 330 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ICAM1P05362 532 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 WEE2P0C1S8 567 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 RGS7P49802 495 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ACER1Q8TDN7 264 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TNFRSF25Q93038 417 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 A8MXQ7 604 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 HIC1Q14526 733 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 LCA5Q86VQ0 697 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 AGR3Q8TD06 166 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 OTUD5Q96G74 571 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 OLFML3Q9NRN5 406 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 SULT1E1P49888 294 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 CST8O60676 142 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 TYK2P29597 1187 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ZBTB7AO95365 584 aa8.74□□□□□ -1.01
ALMS1-208ENST00000620466 ATP6V1G2O95670 118 aa8.74□□□□□ -1.01
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