RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 LMO2P25791 158 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 STAT1P42224 750 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 NDST1P52848 882 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 RAD23BP54727 409 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 ORC1Q13415 861 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 HGSNATQ68CP4 663 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 APPL2Q8NEU8 664 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SPAG5Q96R06 1193 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SPG21Q9NZD8 308 aa22.36■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 CYP26A1O43174 497 aa22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 CA3P07451 260 aa22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 TYMPP19971 482 aa22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM270Q6UE05 265 aa22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM139Q8IV31 216 aa22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SYT11Q9BT88 431 aa22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 ODC1P11926 461 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SKILP12757 684 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 BMPR1AP36894 532 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 MEA1Q16626 185 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC142Q17RM4 750 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 CNGA4Q8IV77 575 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 TDHQ8IZJ6 230 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 PBX4Q9BYU1 374 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 KRT5P13647 590 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 USP8P40818 1118 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 TAP1Q03518 808 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF394Q53GI3 561 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 RTP2Q5QGT7 225 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 TFAP2BQ92481 460 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 PANX2Q96RD6 677 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 CHP1Q99653 195 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 CHST7Q9NS84 486 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG3-202ENST00000617158 SYN3O14994 580 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 TBC1D4O60343 1298 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ATP2C2O75185 946 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 OAZ2O95190 189 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 TPM1P09493 284 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PDGFRBP09619 1106 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CHRNB2P17787 502 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PRKCIP41743 596 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ARID5AQ03989 594 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 UNC93AQ86WB7 457 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA18Q8TC71 538 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM209Q96SK2 561 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PKMYT1Q99640 499 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 TRAPPC3O43617 180 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 FGF18O76093 207 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CFHP08603 1231 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 FERP16591 822 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 GSDMDP57764 484 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PLCB3Q01970 1234 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ASIC2Q16515 512 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ACOT1Q86TX2 421 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms