RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	ITGB3	P05106	788 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CALB1	P05937	261 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	FNTA	P49354	379 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	PDE1B	Q01064	536 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNN4	O15554	427 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CXCL8	P10145	99 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	DRD4	P21917	467 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	GTF2B	Q00403	316 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	DRP2	Q13474	957 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	GCK	P35557	465 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	COPS5	Q92905	334 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CEP41	Q9BYV8	373 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	NCAN	O14594	1321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449		A6NJR5	290 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	RGL2	O15211	777 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MAPK13	O15264	365 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TCF4	P15884	667 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	AGAP3	Q96P47	875 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CAPN9	O14815	690 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC26A4	O43511	780 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	RASSF2	P50749	326 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MTFR1L	Q9H019	292 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	LPXN	O60711	386 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	P4HA1	P13674	534 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	LCP1	P13796	627 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	DSG3	P32926	999 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC1A1	P43005	524 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TFDP1	Q14186	410 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CD302	Q8IX05	232 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	VTN	P04004	478 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	BCAR1	P56945	870 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	STAT4	Q14765	748 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MYH1	P12882	1939 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449		A8MUI8	341 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	COPE	O14579	308 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CREB3	O43889	395 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	KDSR	Q06136	332 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CNGA2	Q16280	664 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	RPTOR	Q8N122	1335 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMD6	Q15008	389 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.41	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms