RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612007.1

ACACA-224, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5

Gene ACACA, Length 451 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-224	ENST00000612007	BRAF	P15056	766 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	TNFSF4	P23510	183 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	CNR2	P34972	360 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	FOXL1	Q12952	345 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	ATP2B3	Q16720	1220 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	FAM209B	Q5JX69	171 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	GORAB	Q5T7V8	394 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	SLFN13	Q68D06	897 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	DOK3	Q7L591	496 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	DPP9	Q86TI2	863 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	FAM83A	Q86UY5	434 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	SP8	Q8IXZ3	490 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	OR2C3	Q8N628	320 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	RNF152	Q8N8N0	203 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	TFAP2C	Q92754	450 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	OR14A2	Q96R54	314 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	SYT17	Q9BSW7	474 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	USP40	Q9NVE5	1235 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	COL20A1	Q9P218	1284 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	MED16	Q9Y2X0	877 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	GLI3	P10071	1580 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	USP32	Q8NFA0	1604 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	DISP1	Q96F81	1524 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	MAP3K5	Q99683	1374 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	POM121B	A6NF01	834 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	DRGX	A6NNA5	263 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007		E9PLN8	166 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	BTN3A1	O00481	513 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	FOXS1	O43638	330 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	DNAJB5	O75953	348 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	AGFG2	O95081	481 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	ABHD16A	O95870	558 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	GNAI3	P08754	354 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	RARB	P10826	455 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	TSHR	P16473	764 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	BMP7	P18075	431 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	STT3A	P46977	705 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	KCNJ5	P48544	419 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	PTTG1IP	P53801	180 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	GNAI1	P63096	354 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	CTBP1	Q13363	440 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	DAG1	Q14118	895 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	SURF1	Q15526	300 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	LONRF3	Q496Y0	759 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	METRNL	Q641Q3	311 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	ZNF365	Q70YC5	407 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	MICU3	Q86XE3	530 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	SYT12	Q8IV01	421 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	FUK	Q8N0W3	1084 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	TMIE	Q8NEW7	156 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	KIAA1191	Q96A73	305 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ACACA-224	ENST00000612007	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9

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